More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3718 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  78.35 
 
 		 447 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  937    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  67.79 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  65.32 
 
 		 451 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  53.62 
 
 		 448 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  51.58 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  51.02 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  49.89 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  49.89 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  49.89 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  49.89 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  49.66 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  49.21 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  43.79 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  44.02 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  44.02 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  44.88 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  43.97 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  44.65 
 
 		 454 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  41.11 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  39.41 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.12 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  39.41 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  36.43 
 
 		 469 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  36.1 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  35.73 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  36.18 
 
 		 457 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  37.36 
 
 		 451 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  38.69 
 
 		 466 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  35.68 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  36.59 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  38.69 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.2 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  38.89 
 
 		 465 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  35.96 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  36.3 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  38.46 
 
 		 469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  35.54 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.38 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  35.84 
 
 		 467 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  35.96 
 
 		 459 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  37.56 
 
 		 457 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  35.59 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  35.84 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  37.61 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  38.19 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  38 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  38 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  35.83 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  37.7 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  37.76 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  35.13 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  35.35 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  36.32 
 
 		 456 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0070  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.16 
 
 		 462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275257  normal  0.0217188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  36.32 
 
 		 456 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  36.28 
 
 		 458 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  34.87 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  35.99 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  36.04 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  37.19 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  37.19 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  37.19 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  35.78 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  36.55 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.32 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  35.7 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  35.97 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  36.05 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  35.75 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  36.08 
 
 		 463 aa  266  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  37.04 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  36.24 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  35.83 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  36.97 
 
 		 479 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  37.26 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  37.7 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  34.1 
 
 		 463 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  35.37 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  38.48 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  33.48 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  39.77 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  34.16 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  35.99 
 
 		 451 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  37.42 
 
 		 473 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  34.88 
 
 		 468 aa  262  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  36.75 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  36.59 
 
 		 457 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  35.99 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  37.78 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.28 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  34.62 
 
 		 450 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>