More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4163 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  96.86 
 
 		 446 aa  892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  89.44 
 
 		 449 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  89.66 
 
 		 449 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  97.53 
 
 		 446 aa  897    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  89.44 
 
 		 449 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  89.24 
 
 		 449 aa  837    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  89.44 
 
 		 449 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  89.44 
 
 		 449 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  96.86 
 
 		 446 aa  892    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  89.44 
 
 		 449 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  68.02 
 
 		 448 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  98.88 
 
 		 446 aa  909    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  68.02 
 
 		 448 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  89.44 
 
 		 449 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  94.17 
 
 		 446 aa  871    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  68.02 
 
 		 448 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  96.86 
 
 		 446 aa  892    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  58.78 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  58.55 
 
 		 454 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  54.65 
 
 		 456 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  51.25 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  51.71 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  49.21 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  48.86 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  48.05 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.41 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.47 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.05 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.87 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  43.2 
 
 		 479 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  41.38 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.73 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.24 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  40.47 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.62 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.05 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.47 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.62 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.11 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.11 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 464 aa  319  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.28 
 
 		 466 aa  319  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 453 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.5 
 
 		 455 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 453 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.41 
 
 		 460 aa  316  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.06 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.62 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  39.08 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.94 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.41 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2166  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.41 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.44 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  38.66 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  38.62 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.64 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  41.43 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.64 
 
 		 455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.84 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  38.27 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  38.95 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  36.72 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.39 
 
 		 463 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.59 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.78 
 
 		 470 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  37.58 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.26 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.43 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  37.5 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.21 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0070  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.5 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275257  normal  0.0217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  40 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.15 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  36.83 
 
 		 452 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.5 
 
 		 467 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  39.82 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  41.31 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.36 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  36.83 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  39.35 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1122  beta alanine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.456667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  38.48 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.53 
 
 		 467 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  35.16 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  38.28 
 
 		 463 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  38.85 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  37.69 
 
 		 458 aa  299  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  37.95 
 
 		 456 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  36.67 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  36.44 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  36.44 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  36.44 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  39.86 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  40.18 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.5 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>