More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1366 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  73.49 
 
 		 441 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  72.92 
 
 		 445 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 441 aa  903    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  76.7 
 
 		 443 aa  701    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  73.97 
 
 		 442 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  73.18 
 
 		 441 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  73.72 
 
 		 441 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  69.46 
 
 		 435 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  67.81 
 
 		 444 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3957  beta alanine--pyruvate transaminase  66.97 
 
 		 444 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.625415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  66.06 
 
 		 441 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  64.37 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1294  beta alanine--pyruvate transaminase  65.39 
 
 		 445 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  68.15 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  64.61 
 
 		 450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  65.39 
 
 		 445 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  64.99 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  63.12 
 
 		 444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.99 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3868  beta alanine--pyruvate transaminase  64.45 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1122  beta alanine--pyruvate transaminase  63.28 
 
 		 438 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.456667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  62.44 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  63.62 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4468  beta alanine--pyruvate transaminase  62.79 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59935 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  62.44 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4248  aminotransferase class-III  62.24 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  62.44 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1442  beta alanine--pyruvate transaminase  61.56 
 
 		 442 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  61.56 
 
 		 442 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  62.04 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  62.27 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  62.27 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  61.57 
 
 		 454 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  62.04 
 
 		 446 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  60.96 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2481  omega amino acid--pyruvate transaminase  62.27 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2046  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.66 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2175  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.66 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2537  beta alanine--pyruvate transaminase  61.75 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  60.18 
 
 		 445 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2567  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.66 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1505  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.66 
 
 		 442 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0670  beta alanine--pyruvate transaminase  61.82 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  61.11 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  61.34 
 
 		 454 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  61.34 
 
 		 454 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  61.95 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0734  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.66 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02393  beta alanine--pyruvate transaminase  63.34 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4383  beta alanine--pyruvate transaminase  63.81 
 
 		 445 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.488386  normal  0.439586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3126  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.66 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4273  beta alanine--pyruvate transaminase  63.81 
 
 		 445 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0078691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3101  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.43 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1078  beta alanine--pyruvate transaminase  63.68 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4340  beta alanine--pyruvate transaminase  61.59 
 
 		 442 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3157  beta alanine--pyruvate transaminase  61.52 
 
 		 445 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3065  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.43 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3022  beta alanine--pyruvate transaminase  61.42 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1370  beta alanine--pyruvate transaminase  59.59 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1184  beta alanine--pyruvate transaminase  61.29 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0905648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4458  beta alanine--pyruvate transaminase  66.13 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.461411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1044  beta alanine--pyruvate transaminase  63.78 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00442858  normal  0.786011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1114  beta alanine--pyruvate transaminase  62.93 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2299  beta alanine--pyruvate transaminase  59.54 
 
 		 453 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.104405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0894  beta alanine--pyruvate transaminase  58.76 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1288  beta alanine--pyruvate transaminase  59.45 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0248  beta alanine--pyruvate transaminase  59.86 
 
 		 443 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1329  beta alanine--pyruvate transaminase  61.33 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759246  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0966  beta alanine--pyruvate transaminase  62.41 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0569565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3237  beta alanine--pyruvate transaminase  64.29 
 
 		 451 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786147  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0278  beta alanine--pyruvate transaminase  59.54 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0205  beta alanine--pyruvate transaminase  60.09 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1242  beta alanine--pyruvate transaminase  61.52 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0868  beta alanine--pyruvate transaminase  57.8 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4294  beta alanine--pyruvate transaminase  56.25 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4059  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7631  omega amino acid--pyruvate transaminase  59.58 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4286  beta alanine--pyruvate transaminase  55.94 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4039  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 449 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3204  beta alanine--pyruvate transaminase  56.02 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1698  beta alanine--pyruvate transaminase  55.56 
 
 		 451 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4313  beta alanine--pyruvate transaminase  56.02 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4053  beta alanine--pyruvate transaminase  56.02 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1578  beta alanine--pyruvate transaminase  55.01 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1380  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2318  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0494  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1541  beta alanine--pyruvate transaminase  56.71 
 
 		 447 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0541648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1009  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1454  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3729  beta alanine--pyruvate transaminase  55.32 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4203  beta alanine--pyruvate transaminase  55.32 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.152237 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0156  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.122523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1096  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 466 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1125  beta alanine--pyruvate transaminase  54.94 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4437  beta alanine--pyruvate transaminase  55.14 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0945399  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1658  beta alanine--pyruvate transaminase  54.86 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6020  beta alanine--pyruvate transaminase  55.24 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  58.72 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0373  beta alanine--pyruvate transaminase  54.67 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>