More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0373 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6020  beta alanine--pyruvate transaminase  76.39 
 
 		 506 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1096  beta alanine--pyruvate transaminase  75.34 
 
 		 466 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414552  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1380  beta alanine--pyruvate transaminase  75.34 
 
 		 451 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1578  beta alanine--pyruvate transaminase  78.67 
 
 		 451 aa  752    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2318  beta alanine--pyruvate transaminase  75.11 
 
 		 503 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0607  beta alanine--pyruvate transaminase  74.25 
 
 		 446 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0494  beta alanine--pyruvate transaminase  75.34 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789505  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1698  beta alanine--pyruvate transaminase  78.21 
 
 		 451 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1658  beta alanine--pyruvate transaminase  73.78 
 
 		 503 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0373  beta alanine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 449 aa  930    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4286  beta alanine--pyruvate transaminase  77.21 
 
 		 452 aa  742    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4103  beta alanine--pyruvate transaminase  76.68 
 
 		 476 aa  703    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3455  beta alanine--pyruvate transaminase  76.4 
 
 		 452 aa  699    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0156  beta alanine--pyruvate transaminase  75.34 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.122523  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1009  beta alanine--pyruvate transaminase  75.34 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3204  beta alanine--pyruvate transaminase  77.52 
 
 		 451 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4053  beta alanine--pyruvate transaminase  77.52 
 
 		 451 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1454  beta alanine--pyruvate transaminase  75.34 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4294  beta alanine--pyruvate transaminase  77.65 
 
 		 452 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3729  beta alanine--pyruvate transaminase  77.75 
 
 		 452 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4437  beta alanine--pyruvate transaminase  74.2 
 
 		 453 aa  705    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0945399  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4203  beta alanine--pyruvate transaminase  77.98 
 
 		 452 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.152237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4313  beta alanine--pyruvate transaminase  77.52 
 
 		 451 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4039  beta alanine--pyruvate transaminase  81.92 
 
 		 449 aa  784    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4744  beta alanine--pyruvate transaminase  77.4 
 
 		 455 aa  694    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0099  beta alanine--pyruvate transaminase  66.67 
 
 		 445 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1125  beta alanine--pyruvate transaminase  66.97 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4059  beta alanine--pyruvate transaminase  64.14 
 
 		 447 aa  618  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1538  beta alanine--pyruvate transaminase  66.59 
 
 		 441 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605629  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0641  beta alanine--pyruvate transaminase  63.64 
 
 		 448 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000208171  hitchhiker  0.000240865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4567  beta alanine--pyruvate transaminase  63.4 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000220823  hitchhiker  0.00375076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3695  beta alanine--pyruvate transaminase  62.19 
 
 		 448 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0208  beta alanine--pyruvate transaminase  60.27 
 
 		 448 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1541  beta alanine--pyruvate transaminase  63.76 
 
 		 447 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0541648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01620  beta alanine--pyruvate transaminase  60.49 
 
 		 448 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.870512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0596  beta alanine--pyruvate transaminase  63.64 
 
 		 448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0636  beta alanine--pyruvate transaminase  63.87 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000579896  normal  0.273226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6274  omega amino acid--pyruvate transaminase  61.21 
 
 		 447 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0774  beta-alanine--pyruvate aminotransferase  60.45 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0678  beta alanine--pyruvate transaminase  60 
 
 		 448 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0685  beta alanine--pyruvate transaminase  59.51 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22800  aminotransferase class-III protein  66.67 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  56.38 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  55.45 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  54.67 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  52.9 
 
 		 435 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  53.06 
 
 		 441 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  54.69 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  53.17 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  54.95 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  53.13 
 
 		 442 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  53.53 
 
 		 446 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0248  beta alanine--pyruvate transaminase  53.58 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  52.09 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1442  beta alanine--pyruvate transaminase  53.21 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  55.81 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3022  beta alanine--pyruvate transaminase  56.67 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4468  beta alanine--pyruvate transaminase  52.19 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4340  beta alanine--pyruvate transaminase  52.79 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525424 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  52.71 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  55.45 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4273  beta alanine--pyruvate transaminase  51.94 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0078691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4383  beta alanine--pyruvate transaminase  51.94 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.488386  normal  0.439586 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  52.49 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0670  beta alanine--pyruvate transaminase  53.26 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  55.35 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.21 
 
 		 445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  55.68 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  50.45 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3957  beta alanine--pyruvate transaminase  54.12 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.625415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1294  beta alanine--pyruvate transaminase  52.87 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  52.87 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  54.76 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3868  beta alanine--pyruvate transaminase  50.56 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  53.1 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.47 
 
 		 441 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  51.25 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  52.29 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  54.76 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  54.76 
 
 		 445 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1122  beta alanine--pyruvate transaminase  52.16 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.456667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  54.76 
 
 		 454 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02393  beta alanine--pyruvate transaminase  50.57 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  54.52 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.24 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  52.53 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.53 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1078  beta alanine--pyruvate transaminase  51.69 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  50.23 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0205  beta alanine--pyruvate transaminase  52.67 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3065  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  51.94 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2481  omega amino acid--pyruvate transaminase  51.04 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0734  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2567  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2175  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3126  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4248  aminotransferase class-III  50.7 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3101  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1114  beta alanine--pyruvate transaminase  54.48 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>