More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0685 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0596  beta alanine--pyruvate transaminase  84.63 
 
 		 448 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0774  beta-alanine--pyruvate aminotransferase  87.08 
 
 		 448 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0678  beta alanine--pyruvate transaminase  87.08 
 
 		 448 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6274  omega amino acid--pyruvate transaminase  74.03 
 
 		 447 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0208  beta alanine--pyruvate transaminase  79.91 
 
 		 448 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0685  beta alanine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 449 aa  931    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0641  beta alanine--pyruvate transaminase  85.08 
 
 		 448 aa  817    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000208171  hitchhiker  0.000240865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3695  beta alanine--pyruvate transaminase  78.84 
 
 		 448 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4567  beta alanine--pyruvate transaminase  85.08 
 
 		 448 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000220823  hitchhiker  0.00375076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01620  beta alanine--pyruvate transaminase  80.13 
 
 		 448 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.870512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0636  beta alanine--pyruvate transaminase  84.86 
 
 		 448 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000579896  normal  0.273226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4039  beta alanine--pyruvate transaminase  64.67 
 
 		 449 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22800  aminotransferase class-III protein  73.37 
 
 		 412 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1578  beta alanine--pyruvate transaminase  63.04 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4294  beta alanine--pyruvate transaminase  61.11 
 
 		 452 aa  584  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4286  beta alanine--pyruvate transaminase  61.35 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1125  beta alanine--pyruvate transaminase  63.25 
 
 		 447 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1698  beta alanine--pyruvate transaminase  62.82 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3729  beta alanine--pyruvate transaminase  63.05 
 
 		 452 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4203  beta alanine--pyruvate transaminase  63.05 
 
 		 452 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.152237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4059  beta alanine--pyruvate transaminase  61.7 
 
 		 447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4053  beta alanine--pyruvate transaminase  62.82 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3204  beta alanine--pyruvate transaminase  62.82 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4313  beta alanine--pyruvate transaminase  62.82 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0099  beta alanine--pyruvate transaminase  60.55 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1541  beta alanine--pyruvate transaminase  62.84 
 
 		 447 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0541648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0607  beta alanine--pyruvate transaminase  60.58 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1658  beta alanine--pyruvate transaminase  62.36 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6020  beta alanine--pyruvate transaminase  61.89 
 
 		 506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0373  beta alanine--pyruvate transaminase  59.51 
 
 		 449 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2318  beta alanine--pyruvate transaminase  59.38 
 
 		 503 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1096  beta alanine--pyruvate transaminase  59.38 
 
 		 466 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1009  beta alanine--pyruvate transaminase  59.38 
 
 		 466 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4437  beta alanine--pyruvate transaminase  60.32 
 
 		 453 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0945399  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1380  beta alanine--pyruvate transaminase  59.16 
 
 		 451 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0494  beta alanine--pyruvate transaminase  59.16 
 
 		 466 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4103  beta alanine--pyruvate transaminase  61.25 
 
 		 476 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0156  beta alanine--pyruvate transaminase  59.16 
 
 		 466 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.122523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1454  beta alanine--pyruvate transaminase  59.16 
 
 		 466 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4744  beta alanine--pyruvate transaminase  61.57 
 
 		 455 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3455  beta alanine--pyruvate transaminase  61.25 
 
 		 452 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1538  beta alanine--pyruvate transaminase  58.26 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605629  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  53 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  52.07 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  51.74 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  51.62 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  49.88 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  51.23 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.53 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  49.54 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.43 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.43 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  47.54 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  50.46 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4340  beta alanine--pyruvate transaminase  51.04 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1370  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4468  beta alanine--pyruvate transaminase  50.12 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  49.22 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1442  beta alanine--pyruvate transaminase  49.31 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2481  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.11 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3868  beta alanine--pyruvate transaminase  49.21 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4273  beta alanine--pyruvate transaminase  49.77 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0078691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  48.27 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0670  beta alanine--pyruvate transaminase  51.51 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0205  beta alanine--pyruvate transaminase  49.77 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4383  beta alanine--pyruvate transaminase  49.77 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.488386  normal  0.439586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  49.21 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  50 
 
 		 444 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  48.23 
 
 		 442 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  49.55 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.54 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0248  beta alanine--pyruvate transaminase  50.23 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  48.62 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1505  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.43 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2046  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.2 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2567  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.2 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2175  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.2 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3126  omega amino acid--pyruvate transaminase  48.75 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0734  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.2 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3065  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.2 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3101  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.2 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  49.31 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3957  beta alanine--pyruvate transaminase  47.96 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.625415 
 
 
-
 
NC_003296  RS02393  beta alanine--pyruvate transaminase  48.65 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  49.77 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  48.28 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  49.44 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  49.77 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1964  beta alanine--pyruvate transaminase  48.56 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4248  aminotransferase class-III  47.47 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1184  beta alanine--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0905648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  48.17 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>