More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0678 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0596  beta alanine--pyruvate transaminase  84.82 
 
 		 448 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0774  beta-alanine--pyruvate aminotransferase  95.54 
 
 		 448 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0678  beta alanine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 448 aa  933    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6274  omega amino acid--pyruvate transaminase  75.17 
 
 		 447 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0685  beta alanine--pyruvate transaminase  87.08 
 
 		 449 aa  810    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4567  beta alanine--pyruvate transaminase  85.27 
 
 		 448 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000220823  hitchhiker  0.00375076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0208  beta alanine--pyruvate transaminase  79 
 
 		 448 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0641  beta alanine--pyruvate transaminase  84.6 
 
 		 448 aa  817    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000208171  hitchhiker  0.000240865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01620  beta alanine--pyruvate transaminase  79.22 
 
 		 448 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.870512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0636  beta alanine--pyruvate transaminase  84.82 
 
 		 448 aa  793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000579896  normal  0.273226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3695  beta alanine--pyruvate transaminase  77.23 
 
 		 448 aa  752    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22800  aminotransferase class-III protein  74.27 
 
 		 412 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4039  beta alanine--pyruvate transaminase  62.44 
 
 		 449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1578  beta alanine--pyruvate transaminase  64.02 
 
 		 451 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4286  beta alanine--pyruvate transaminase  63.32 
 
 		 452 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4203  beta alanine--pyruvate transaminase  63.19 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.152237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4294  beta alanine--pyruvate transaminase  62.5 
 
 		 452 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0099  beta alanine--pyruvate transaminase  61.98 
 
 		 445 aa  584  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1698  beta alanine--pyruvate transaminase  62.73 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1125  beta alanine--pyruvate transaminase  64.2 
 
 		 447 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3729  beta alanine--pyruvate transaminase  63.19 
 
 		 452 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4053  beta alanine--pyruvate transaminase  62.27 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3204  beta alanine--pyruvate transaminase  62.27 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4313  beta alanine--pyruvate transaminase  62.27 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6020  beta alanine--pyruvate transaminase  62.94 
 
 		 506 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4059  beta alanine--pyruvate transaminase  58.43 
 
 		 447 aa  572  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1541  beta alanine--pyruvate transaminase  62.96 
 
 		 447 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0541648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1658  beta alanine--pyruvate transaminase  61.57 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4437  beta alanine--pyruvate transaminase  60.14 
 
 		 453 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0945399  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0607  beta alanine--pyruvate transaminase  61.34 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3455  beta alanine--pyruvate transaminase  61.07 
 
 		 452 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2318  beta alanine--pyruvate transaminase  60.19 
 
 		 503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4103  beta alanine--pyruvate transaminase  61.07 
 
 		 476 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0373  beta alanine--pyruvate transaminase  60 
 
 		 449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4744  beta alanine--pyruvate transaminase  61.72 
 
 		 455 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1096  beta alanine--pyruvate transaminase  59.95 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1009  beta alanine--pyruvate transaminase  59.95 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0156  beta alanine--pyruvate transaminase  59.72 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.122523  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1380  beta alanine--pyruvate transaminase  59.72 
 
 		 451 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1454  beta alanine--pyruvate transaminase  59.72 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0494  beta alanine--pyruvate transaminase  59.72 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789505  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1538  beta alanine--pyruvate transaminase  57.74 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605629  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  53.88 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  50.92 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  50.68 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  50.67 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  51.28 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  51.28 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  49.77 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 444 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  51.06 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1442  beta alanine--pyruvate transaminase  49.66 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  52.2 
 
 		 441 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.59 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  49.43 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  48.89 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  50.7 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2481  omega amino acid--pyruvate transaminase  51.26 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4468  beta alanine--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  48.86 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  49.66 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1505  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.68 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3868  beta alanine--pyruvate transaminase  48.51 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2046  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2175  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3126  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0734  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2567  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3101  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1370  beta alanine--pyruvate transaminase  51.14 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3065  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0670  beta alanine--pyruvate transaminase  51.15 
 
 		 442 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0205  beta alanine--pyruvate transaminase  50.23 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  49.89 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4340  beta alanine--pyruvate transaminase  50.69 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3022  beta alanine--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  49.89 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0248  beta alanine--pyruvate transaminase  50.92 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  50 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  48.72 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 446 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  50 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4273  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0078691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  49.44 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 446 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  48.5 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  49.66 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4383  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.488386  normal  0.439586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  49.89 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  49.89 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  46.9 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1294  beta alanine--pyruvate transaminase  50.72 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  50.72 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_003296  RS02393  beta alanine--pyruvate transaminase  49.31 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1184  beta alanine--pyruvate transaminase  51.38 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0905648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1078  beta alanine--pyruvate transaminase  46.98 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>