More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1964 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1964  beta alanine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 441 aa  895    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  57.76 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  54.33 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  54.55 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  54.67 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  53.99 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  55.87 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  53.99 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3157  beta alanine--pyruvate transaminase  53.15 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  54.75 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  54.46 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  55.26 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3463  aminotransferase class-III  52.83 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  53.99 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4468  beta alanine--pyruvate transaminase  52.18 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2537  beta alanine--pyruvate transaminase  53.72 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  53.85 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  53.6 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4273  beta alanine--pyruvate transaminase  52.48 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0078691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  54.4 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4383  beta alanine--pyruvate transaminase  52.48 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.488386  normal  0.439586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  51.69 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3868  beta alanine--pyruvate transaminase  54.55 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  53.42 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_003296  RS02393  beta alanine--pyruvate transaminase  52.66 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1078  beta alanine--pyruvate transaminase  54.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  53.26 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  53.05 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  52.37 
 
 		 444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1294  beta alanine--pyruvate transaminase  53.26 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2299  beta alanine--pyruvate transaminase  51.86 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.104405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2848  beta alanine--pyruvate transaminase  49.54 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119562  normal  0.778304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0894  beta alanine--pyruvate transaminase  49.1 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1288  beta alanine--pyruvate transaminase  52.02 
 
 		 448 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1370  beta alanine--pyruvate transaminase  50.56 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3957  beta alanine--pyruvate transaminase  51.6 
 
 		 444 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.625415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0670  beta alanine--pyruvate transaminase  52.68 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1122  beta alanine--pyruvate transaminase  50.23 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.456667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4340  beta alanine--pyruvate transaminase  51.98 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525424 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2567  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2046  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2175  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0248  beta alanine--pyruvate transaminase  51.05 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3126  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3065  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1184  beta alanine--pyruvate transaminase  50.67 
 
 		 448 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0905648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0734  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  51.24 
 
 		 446 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3101  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.58 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1505  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.11 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0641  beta alanine--pyruvate transaminase  49.33 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000208171  hitchhiker  0.000240865 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  52.09 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1442  beta alanine--pyruvate transaminase  51.03 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4567  beta alanine--pyruvate transaminase  49.33 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000220823  hitchhiker  0.00375076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0208  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 448 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  51.38 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2481  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.09 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  50.22 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01620  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.870512 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  50.11 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1541  beta alanine--pyruvate transaminase  53.09 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0541648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  50.12 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  50.34 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  49.31 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  49.88 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  49.65 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  49.66 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  51.04 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  49.65 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4059  beta alanine--pyruvate transaminase  48.28 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6274  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.12 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2318  beta alanine--pyruvate transaminase  51.39 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3204  beta alanine--pyruvate transaminase  50.12 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1698  beta alanine--pyruvate transaminase  49.88 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4248  aminotransferase class-III  50.12 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1658  beta alanine--pyruvate transaminase  51.16 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1096  beta alanine--pyruvate transaminase  51.16 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3695  beta alanine--pyruvate transaminase  48.97 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4053  beta alanine--pyruvate transaminase  50.12 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4313  beta alanine--pyruvate transaminase  50.12 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1380  beta alanine--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0494  beta alanine--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4458  beta alanine--pyruvate transaminase  54.19 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.461411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0636  beta alanine--pyruvate transaminase  48.66 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000579896  normal  0.273226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0205  beta alanine--pyruvate transaminase  49.65 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0278  beta alanine--pyruvate transaminase  51.86 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3022  beta alanine--pyruvate transaminase  49.21 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3237  beta alanine--pyruvate transaminase  53.95 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786147  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1454  beta alanine--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1009  beta alanine--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0156  beta alanine--pyruvate transaminase  50.93 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.122523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0596  beta alanine--pyruvate transaminase  48.66 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4286  beta alanine--pyruvate transaminase  48.24 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1329  beta alanine--pyruvate transaminase  51.75 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759246  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1242  beta alanine--pyruvate transaminase  50.68 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4294  beta alanine--pyruvate transaminase  48.95 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1044  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00442858  normal  0.786011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0774  beta-alanine--pyruvate aminotransferase  48.95 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0728116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>