More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6480 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  933    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  99.78 
 
 		 454 aa  928    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  58.89 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  58.31 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  58.78 
 
 		 446 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  58.12 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  58.31 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  58.55 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  58.56 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  58.31 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  58.31 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  54.11 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  54.34 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  54.34 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  49.44 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  47.07 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  44.22 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  44.65 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  43.37 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  43.49 
 
 		 447 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.46 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  41.18 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  42.22 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.84 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.37 
 
 		 449 aa  313  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.25 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.73 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.98 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  35.45 
 
 		 466 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  39.67 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  38.64 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.33 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  39.76 
 
 		 456 aa  295  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.34 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.04 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  38.43 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  36.72 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.7 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.94 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.89 
 
 		 471 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2656  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.37 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.12 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.12 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 464 aa  289  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  37.11 
 
 		 459 aa  289  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  39.2 
 
 		 456 aa  289  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.2 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.55 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  37.17 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2166  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.79 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  37.59 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.56 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  36.67 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  39.15 
 
 		 479 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1002  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.89 
 
 		 491 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.19 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  37.14 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.26 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  36.89 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  37.05 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  37.59 
 
 		 458 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.02 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  37.78 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  36.11 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  36.87 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.16 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.83 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  36.41 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  34.95 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.64 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  33.71 
 
 		 451 aa  279  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  38.24 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  36.88 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  35.88 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6893  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  37.36 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.2 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  35.25 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  37.84 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  37.31 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  36.47 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  36.83 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  36.83 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  36.83 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  36.93 
 
 		 459 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.12 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  37.22 
 
 		 464 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  34.73 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  36.4 
 
 		 457 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  38.48 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.12 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  37.05 
 
 		 458 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  35.93 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>