More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1287 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  71.02 
 
 
464 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  72.51 
 
 
456 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  73.66 
 
 
448 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  69.87 
 
 
462 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  68.35 
 
 
458 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  70.87 
 
 
460 aa  648    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  936    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  73.88 
 
 
448 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  72.21 
 
 
458 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  72.35 
 
 
454 aa  669    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  69.77 
 
 
457 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  68.44 
 
 
461 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  68.44 
 
 
461 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  68.22 
 
 
461 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  69 
 
 
462 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  68.96 
 
 
456 aa  621  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  67.83 
 
 
458 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  67.41 
 
 
468 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  67.11 
 
 
461 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  67.34 
 
 
464 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  62.3 
 
 
463 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  69.18 
 
 
438 aa  586  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  61.69 
 
 
460 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  56.98 
 
 
464 aa  521  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  53.78 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  53.6 
 
 
454 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  49.03 
 
 
465 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  49.13 
 
 
465 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  49.34 
 
 
465 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  49.56 
 
 
465 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  49.34 
 
 
465 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  49.34 
 
 
465 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  49.78 
 
 
462 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  48.27 
 
 
479 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.01 
 
 
454 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  42.99 
 
 
455 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  45.65 
 
 
449 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.19 
 
 
451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.34 
 
 
456 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.34 
 
 
456 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  40.56 
 
 
455 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  42.89 
 
 
456 aa  323  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  43.06 
 
 
451 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  43.85 
 
 
454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.86 
 
 
453 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.34 
 
 
450 aa  319  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.62 
 
 
453 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.21 
 
 
454 aa  317  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.6 
 
 
453 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.38 
 
 
453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.82 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  43.13 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.51 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  40.28 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  39.81 
 
 
443 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  40.22 
 
 
450 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  41.42 
 
 
452 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40.66 
 
 
471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.35 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.16 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.18 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.31 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  42.25 
 
 
449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  42.25 
 
 
449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  43.54 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  42.02 
 
 
449 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  42.02 
 
 
449 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  42.02 
 
 
449 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  41.84 
 
 
449 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  42.02 
 
 
449 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.59 
 
 
466 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  42.02 
 
 
449 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.35 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  42.25 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  43.3 
 
 
448 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  43.3 
 
 
448 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.52 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.74 
 
 
456 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  40.43 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.35 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  40.43 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  40.43 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  40.38 
 
 
446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.72 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  41.61 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.17 
 
 
478 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  41.55 
 
 
446 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.55 
 
 
464 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  41.31 
 
 
446 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.38 
 
 
456 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  41.55 
 
 
446 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.32 
 
 
451 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  43.97 
 
 
452 aa  299  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.54 
 
 
459 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  38.78 
 
 
450 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.91 
 
 
463 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  38.56 
 
 
449 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  38.56 
 
 
449 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  39.17 
 
 
467 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  39.15 
 
 
450 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>