More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0575 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  67.63 
 
 		 462 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  72.35 
 
 		 459 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  69.44 
 
 		 448 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  72.61 
 
 		 458 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  934    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  71.27 
 
 		 448 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  66.67 
 
 		 458 aa  621  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  68.21 
 
 		 464 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  66.59 
 
 		 460 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  66.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  66.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  66.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  66.96 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  65.01 
 
 		 457 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  66.96 
 
 		 458 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  64.84 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  66.29 
 
 		 456 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  65.55 
 
 		 461 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  61.66 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  62.3 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  66.51 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  59.24 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  62.08 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  55.48 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  53.88 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  48.34 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  48.23 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  51.95 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  48.06 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  48.12 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  47.67 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  47.45 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  47.45 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  48.67 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  46.59 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  43.84 
 
 		 454 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.57 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.95 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.9 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.02 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.19 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.02 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.84 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.97 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.15 
 
 		 455 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.51 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.81 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.26 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.13 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.67 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.24 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.86 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  41.39 
 
 		 452 aa  306  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  41.37 
 
 		 448 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  41.37 
 
 		 448 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  41.13 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.34 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.61 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.13 
 
 		 453 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.03 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.91 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  37.14 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  38.48 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.51 
 
 		 466 aa  296  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  41.94 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  38.16 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.82 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  38.05 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.36 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37.82 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  37.82 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.82 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.59 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  37.59 
 
 		 449 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 464 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  37.59 
 
 		 450 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.68 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  40.33 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  36.95 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.72 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  40.48 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  37.47 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  37.44 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>