More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1235 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  98.48 
 
 
461 aa  928    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  89.18 
 
 
462 aa  827    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  74.45 
 
 
458 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  87.2 
 
 
461 aa  808    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  84.68 
 
 
456 aa  781    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  72.77 
 
 
458 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  72.59 
 
 
464 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  71.27 
 
 
458 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  80.73 
 
 
438 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  71.98 
 
 
457 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  70.09 
 
 
468 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  70.07 
 
 
460 aa  628  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  68.44 
 
 
459 aa  627  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  67.48 
 
 
448 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  69.47 
 
 
456 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  69.2 
 
 
464 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  66.44 
 
 
454 aa  608  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  68.37 
 
 
448 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  64.13 
 
 
463 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  64.38 
 
 
462 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  57.67 
 
 
460 aa  549  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  52.2 
 
 
464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  49.22 
 
 
478 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  49.65 
 
 
454 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  44.67 
 
 
479 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  45.84 
 
 
465 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  45.33 
 
 
465 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  44.3 
 
 
465 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  44.3 
 
 
465 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  45.83 
 
 
462 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  44.66 
 
 
465 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  44.3 
 
 
465 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.64 
 
 
450 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  44.66 
 
 
449 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.28 
 
 
451 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.57 
 
 
451 aa  312  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.66 
 
 
454 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.63 
 
 
443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.78 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.01 
 
 
455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.28 
 
 
448 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.28 
 
 
448 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.05 
 
 
448 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.89 
 
 
454 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.47 
 
 
468 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.26 
 
 
459 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.34 
 
 
455 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  39.96 
 
 
449 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  40.09 
 
 
470 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.85 
 
 
457 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.63 
 
 
470 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.32 
 
 
470 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.94 
 
 
453 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.2 
 
 
457 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.81 
 
 
453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  39.18 
 
 
453 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  38.19 
 
 
463 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.58 
 
 
453 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  35.91 
 
 
465 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.39 
 
 
454 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  36.9 
 
 
456 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.94 
 
 
456 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  36.47 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  36.4 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  39.42 
 
 
452 aa  286  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.19 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.72 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.19 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.74 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.74 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  36.57 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  35.67 
 
 
465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  36.24 
 
 
450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  35.35 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.22 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.91 
 
 
457 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.35 
 
 
455 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  37.47 
 
 
463 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.81 
 
 
467 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.42 
 
 
450 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.38 
 
 
466 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.04 
 
 
450 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.04 
 
 
450 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38.59 
 
 
449 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  36.82 
 
 
449 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  36.82 
 
 
449 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  36.18 
 
 
457 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  40.57 
 
 
450 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.34 
 
 
450 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.14 
 
 
467 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  36.6 
 
 
449 aa  279  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.63 
 
 
452 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.42 
 
 
450 aa  279  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  35.57 
 
 
459 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  38.35 
 
 
445 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.12 
 
 
449 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.12 
 
 
449 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.24 
 
 
464 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>