More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3534 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  959    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  99.57 
 
 		 467 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  96.57 
 
 		 467 aa  917    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  49.08 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  49.08 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  49.08 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  48.85 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  49.08 
 
 		 473 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  49.31 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1858  hypothetical protein  48.85 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000249145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  48.67 
 
 		 470 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  48.43 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  48.19 
 
 		 470 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  42.25 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  46.25 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  43.74 
 
 		 463 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  42.7 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.82 
 
 		 466 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.36 
 
 		 466 aa  326  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.93 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.82 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 454 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.82 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.08 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.75 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.75 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.63 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.37 
 
 		 455 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.86 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  38.36 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.85 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.71 
 
 		 456 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.12 
 
 		 463 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.27 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.16 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  36.59 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.83 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.67 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.76 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  36.76 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.27 
 
 		 452 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.53 
 
 		 453 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.53 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.98 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39 
 
 		 485 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.73 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  36.45 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  35.48 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  38.16 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  39.23 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.27 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  39.69 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  38.16 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  39.07 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.59 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  37.19 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  36.47 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  38.95 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  35.62 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  37.42 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  37.06 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  37.19 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  37.19 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  36.97 
 
 		 466 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  38.92 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.37 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  37.61 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  37.76 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  37.44 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  39.13 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.69 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  40.14 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.13 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  35.84 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  38.99 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  39.36 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  40.14 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  36.6 
 
 		 457 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  37.89 
 
 		 480 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  39.64 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  36.98 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  38 
 
 		 475 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.09 
 
 		 465 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  37 
 
 		 457 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  40.19 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  38.26 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  36.26 
 
 		 456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  36.62 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  38.03 
 
 		 477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  35.4 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  35.85 
 
 		 456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  39.15 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  36.19 
 
 		 465 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  36.19 
 
 		 465 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>