More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4663 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  100 
 
 		 451 aa  930    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  66.97 
 
 		 460 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  68.25 
 
 		 466 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  65.77 
 
 		 457 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  64.71 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  65.08 
 
 		 454 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  65.53 
 
 		 453 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  65.31 
 
 		 455 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  65.08 
 
 		 453 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  65.08 
 
 		 454 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  65.08 
 
 		 453 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  64.8 
 
 		 453 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  64.71 
 
 		 456 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  64.71 
 
 		 456 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  62.9 
 
 		 457 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  63.86 
 
 		 452 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  63.86 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  63.41 
 
 		 452 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  58.41 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  58.84 
 
 		 456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  57.73 
 
 		 455 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  57.11 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  59.37 
 
 		 465 aa  538  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  56.4 
 
 		 478 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  56.5 
 
 		 482 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  56.4 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  55.73 
 
 		 461 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  56.5 
 
 		 481 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  55.73 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  55.96 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  55.73 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  53.27 
 
 		 478 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  54.48 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  54.48 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  56.28 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  52.94 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  56.5 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  56.28 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  54.26 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  54.26 
 
 		 475 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  54.26 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  54.04 
 
 		 477 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  53.66 
 
 		 476 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  54.26 
 
 		 475 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 477 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  53.27 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  55.06 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  52.57 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  55.96 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  55.38 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  54.5 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  51.35 
 
 		 460 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  52.48 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  52.69 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  51.35 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  55.51 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  50.68 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  53.12 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  54.73 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  50.69 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  50.69 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  50.69 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  48.53 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  44.39 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.32 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.67 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  42.92 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  44.6 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.35 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.13 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  40.58 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  43.58 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  42.53 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  43.47 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  43.74 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.46 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.94 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  41.11 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  42.79 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  41.93 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  39.37 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  41.48 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  42.72 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.15 
 
 		 456 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  42 
 
 		 467 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  42.32 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  43.13 
 
 		 468 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  44.32 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  41.07 
 
 		 455 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.18 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  41.4 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  41.22 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  41.22 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  42.67 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  38.53 
 
 		 460 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  38.14 
 
 		 460 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  42.5 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>