More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2724 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  956    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  68.18 
 
 
468 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  63.2 
 
 
469 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  63.82 
 
 
465 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  64.43 
 
 
459 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  60.96 
 
 
457 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  60.52 
 
 
465 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  60.92 
 
 
458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  62.2 
 
 
457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  62.39 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  62.61 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  62.39 
 
 
464 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  59.43 
 
 
457 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  63.05 
 
 
464 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  59.08 
 
 
457 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  62.17 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  62.17 
 
 
464 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  58.99 
 
 
459 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  58.99 
 
 
459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  60.22 
 
 
463 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  59.64 
 
 
456 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  58.84 
 
 
467 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  57.61 
 
 
460 aa  538  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  57.3 
 
 
467 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  58.04 
 
 
463 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  46.26 
 
 
455 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  45.95 
 
 
460 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  43.94 
 
 
456 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  45.71 
 
 
460 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  45.73 
 
 
468 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  44.22 
 
 
463 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  45.15 
 
 
459 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  43.91 
 
 
456 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  44.13 
 
 
456 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  44.04 
 
 
456 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  43.48 
 
 
460 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  44.4 
 
 
460 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  45.39 
 
 
450 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.5 
 
 
456 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  44.42 
 
 
457 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  45.92 
 
 
457 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.63 
 
 
460 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.65 
 
 
466 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  44.42 
 
 
455 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  43.74 
 
 
451 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  45.65 
 
 
462 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  44.69 
 
 
456 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.73 
 
 
463 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  42.12 
 
 
461 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.73 
 
 
485 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.42 
 
 
453 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  42.83 
 
 
461 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  41.28 
 
 
450 aa  363  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  44.99 
 
 
456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  44.99 
 
 
456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  42.29 
 
 
471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  42.95 
 
 
454 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.09 
 
 
456 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  43.97 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  43.3 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  42.02 
 
 
453 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  42.79 
 
 
453 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  43.75 
 
 
480 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  43.75 
 
 
480 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  42.02 
 
 
453 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  43.75 
 
 
480 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.93 
 
 
463 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  43.53 
 
 
477 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.72 
 
 
458 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.51 
 
 
449 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  43.3 
 
 
477 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.17 
 
 
460 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  43.3 
 
 
480 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  41.96 
 
 
472 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  42.79 
 
 
455 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  42.28 
 
 
449 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  42.19 
 
 
472 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  41.96 
 
 
477 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  41.96 
 
 
476 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  41.96 
 
 
472 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  42.06 
 
 
458 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.37 
 
 
454 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  41.74 
 
 
475 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  41.74 
 
 
472 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  41.74 
 
 
475 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.04 
 
 
451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.29 
 
 
455 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  42.35 
 
 
464 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  41.78 
 
 
465 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  42.33 
 
 
460 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  42.08 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  41.74 
 
 
478 aa  340  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  42.13 
 
 
464 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  42.13 
 
 
464 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  40.6 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  42.19 
 
 
463 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  39.3 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  41.65 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  40.38 
 
 
461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.3 
 
 
452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>