More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6646 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  68.78 
 
 
460 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  68.78 
 
 
460 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  69.49 
 
 
456 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  100 
 
 
463 aa  957    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  70.52 
 
 
460 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  69.96 
 
 
460 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  69 
 
 
460 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  70.52 
 
 
460 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  57.8 
 
 
464 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  56.54 
 
 
478 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  56.64 
 
 
472 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  56.86 
 
 
472 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  57.71 
 
 
481 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  58.19 
 
 
480 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  57.36 
 
 
464 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  58.41 
 
 
480 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  57.36 
 
 
464 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  58.19 
 
 
480 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  56.64 
 
 
472 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  57.52 
 
 
477 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  56.42 
 
 
475 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  56.42 
 
 
472 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  58.02 
 
 
480 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  56.42 
 
 
475 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  56.61 
 
 
482 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  56.92 
 
 
461 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  57.3 
 
 
477 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  56.7 
 
 
461 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  55.88 
 
 
477 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  55.88 
 
 
476 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  57.52 
 
 
475 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  54.85 
 
 
455 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  56.61 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  55.07 
 
 
455 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  56.64 
 
 
465 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  54.5 
 
 
454 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  55.11 
 
 
457 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  53.23 
 
 
460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  53.67 
 
 
456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  53.83 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  53.67 
 
 
456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  52.48 
 
 
451 aa  514  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  54.91 
 
 
457 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  52.9 
 
 
453 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  52.68 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  52.68 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  52.68 
 
 
453 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  54.25 
 
 
456 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  52.89 
 
 
454 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  53.29 
 
 
455 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  53.06 
 
 
455 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  52.44 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  51.09 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  51.11 
 
 
459 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  50.45 
 
 
460 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  50.45 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  50 
 
 
452 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  50 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  50.99 
 
 
478 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  50.22 
 
 
478 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  49.56 
 
 
464 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  49.32 
 
 
466 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  52.24 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  51.43 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  50 
 
 
465 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  46.88 
 
 
458 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  40.85 
 
 
463 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.19 
 
 
468 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.67 
 
 
456 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.82 
 
 
456 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.81 
 
 
451 aa  346  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  40.45 
 
 
456 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  40.76 
 
 
455 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.19 
 
 
468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  40.76 
 
 
458 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  39.5 
 
 
460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.05 
 
 
467 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.27 
 
 
465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.73 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.51 
 
 
470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.5 
 
 
460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.05 
 
 
468 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.98 
 
 
459 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  40.58 
 
 
469 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.32 
 
 
449 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.61 
 
 
467 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  41.93 
 
 
463 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  37.86 
 
 
470 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.18 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.93 
 
 
460 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  41.93 
 
 
485 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.09 
 
 
456 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  41.32 
 
 
464 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  39.5 
 
 
449 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  41.87 
 
 
464 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  41.87 
 
 
464 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  41.87 
 
 
464 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.86 
 
 
456 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.12 
 
 
460 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  40.41 
 
 
450 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>