More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3261 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  93.7 
 
 		 468 aa  855    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  100 
 
 		 460 aa  938    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  98.48 
 
 		 460 aa  924    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  61.62 
 
 		 463 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  61.73 
 
 		 459 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  57.37 
 
 		 456 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  57.59 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  57.59 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  55.38 
 
 		 455 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  55.43 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  54.37 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  51.09 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  52.22 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  49.89 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  53.61 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  51.86 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  51.64 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  51.42 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  50.98 
 
 		 485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  48.91 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  49.89 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  51.42 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  48.58 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  44.64 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  44.04 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  44.44 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  44.27 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  43.82 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  45.95 
 
 		 468 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  45.98 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  44.32 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  43.88 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  44.74 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  44.91 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  43.27 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  44.76 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  44.32 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  44.54 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  44.54 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.95 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  43.3 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.14 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  44.42 
 
 		 464 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  44.64 
 
 		 464 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  42.7 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  44.19 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  45.54 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.72 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.15 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.27 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  43.68 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  41.88 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  44.02 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.73 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  42.21 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  42.32 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  43.18 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  42.44 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  42.21 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  42.19 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  42.95 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  43.76 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.45 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.24 
 
 		 454 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  39.78 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  42.24 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  40.71 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.42 
 
 		 456 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 457 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  42.47 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.82 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.53 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.02 
 
 		 451 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  41.65 
 
 		 472 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.14 
 
 		 452 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.5 
 
 		 451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  39.2 
 
 		 457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 460 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.93 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.93 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  41.33 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  41.43 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  43.49 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  41.43 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  41.52 
 
 		 466 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 475 aa  346  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 480 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  41.44 
 
 		 482 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  42.19 
 
 		 464 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  42.19 
 
 		 464 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>