More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3250 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  99.13 
 
 		 460 aa  943    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  100 
 
 		 460 aa  948    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  83.63 
 
 		 456 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  69 
 
 		 463 aa  670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  83.48 
 
 		 460 aa  794    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  94.13 
 
 		 460 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  99.13 
 
 		 460 aa  943    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  83.91 
 
 		 460 aa  824    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  59.29 
 
 		 478 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  59.07 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  58.63 
 
 		 481 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  58.7 
 
 		 477 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  58.48 
 
 		 477 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  58.76 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  58.5 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  58.5 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  58.5 
 
 		 480 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  57.74 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  57.74 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  58.5 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  57.68 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  57.68 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 472 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  57.68 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  57.42 
 
 		 472 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  58.15 
 
 		 461 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  57.93 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  56.62 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  56.99 
 
 		 472 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  56.95 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  57.36 
 
 		 461 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  55.06 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  55.09 
 
 		 455 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  57.52 
 
 		 465 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  55.43 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  53.67 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  55.16 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  52.81 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  52.81 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  52.36 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  52.78 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  52.78 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  51.91 
 
 		 454 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  52.36 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  52.46 
 
 		 452 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  51.79 
 
 		 452 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  52.23 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  51.1 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  50.11 
 
 		 451 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  51.26 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  50.11 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  52.63 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  51.72 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  50.33 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  49.89 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  49.44 
 
 		 459 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  47.79 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  46.84 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  46.94 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  48.57 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  49.33 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  47.78 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  44.98 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  46.95 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.31 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  39.37 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.96 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  42.08 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.95 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.87 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.41 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.65 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  36.7 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  36.48 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  37.11 
 
 		 470 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  39.44 
 
 		 468 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.94 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.17 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.33 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  37.78 
 
 		 460 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  38.72 
 
 		 468 aa  308  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  39.69 
 
 		 461 aa  308  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  37.56 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  34.73 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.62 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.34 
 
 		 449 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  36.4 
 
 		 456 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  40.41 
 
 		 462 aa  302  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  37.09 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  38.18 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  39.65 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.56 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  37.05 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  38.31 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  37.33 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.34 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  38.48 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.62 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>