More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1101 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  100 
 
 
455 aa  933    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  74.55 
 
 
456 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  93.41 
 
 
455 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  58.41 
 
 
451 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  58.24 
 
 
466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  60.55 
 
 
456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  60.55 
 
 
456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  58.6 
 
 
455 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  58.78 
 
 
455 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  59.19 
 
 
460 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  57.84 
 
 
478 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  58.24 
 
 
454 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  59.05 
 
 
457 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  58.24 
 
 
453 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  59.28 
 
 
457 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  57.56 
 
 
454 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  54.19 
 
 
471 aa  532  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  56.66 
 
 
453 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  56.66 
 
 
453 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  57.08 
 
 
453 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  56.24 
 
 
478 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  55.3 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  56.66 
 
 
464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  55.3 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  54.48 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  55.25 
 
 
452 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  55.41 
 
 
482 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  55.86 
 
 
481 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  55.25 
 
 
452 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  55.86 
 
 
475 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  55.86 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  55.86 
 
 
475 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  55.63 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  55.58 
 
 
461 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  55.63 
 
 
472 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  55.63 
 
 
472 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  55.36 
 
 
461 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  55.41 
 
 
477 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  55.41 
 
 
476 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  56.42 
 
 
465 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  55.78 
 
 
464 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  55.33 
 
 
466 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  52.65 
 
 
470 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  51.7 
 
 
460 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  55.11 
 
 
464 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  55.11 
 
 
464 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  54.95 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  54.95 
 
 
480 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  55.41 
 
 
477 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  54.32 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  54.22 
 
 
461 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  55.18 
 
 
475 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  54.73 
 
 
480 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  53.63 
 
 
465 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  54.95 
 
 
477 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  54.73 
 
 
480 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  52.63 
 
 
460 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  53.06 
 
 
463 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  54.42 
 
 
465 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  51.36 
 
 
460 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  51.76 
 
 
458 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  51.13 
 
 
460 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  51.29 
 
 
460 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  51.29 
 
 
460 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  51.29 
 
 
460 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  50.69 
 
 
456 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  44.49 
 
 
456 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  44.2 
 
 
456 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  42.6 
 
 
456 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  41.87 
 
 
456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.45 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  41.65 
 
 
456 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  42.82 
 
 
456 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.73 
 
 
485 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  40.83 
 
 
467 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.73 
 
 
463 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.47 
 
 
463 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  42.38 
 
 
460 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.39 
 
 
460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  40 
 
 
461 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  42.33 
 
 
459 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  41.29 
 
 
468 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.8 
 
 
460 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  40.49 
 
 
458 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.41 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  42.32 
 
 
449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  42.44 
 
 
464 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  42.44 
 
 
464 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.73 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.57 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  40.43 
 
 
467 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  41.86 
 
 
454 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  42.38 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  42.6 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.39 
 
 
470 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  41.57 
 
 
455 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.83 
 
 
449 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  41.26 
 
 
461 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  40.69 
 
 
463 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  42.15 
 
 
464 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>