More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0545 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  100 
 
 
458 aa  932    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  57.02 
 
 
455 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  59.96 
 
 
464 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  56.18 
 
 
457 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  54.88 
 
 
456 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  54.88 
 
 
456 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  54.73 
 
 
452 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  54.75 
 
 
452 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  54.07 
 
 
454 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  54.36 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  55.26 
 
 
453 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  53.51 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  54.81 
 
 
453 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  53.78 
 
 
455 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  52.42 
 
 
460 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  54.59 
 
 
453 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  54.08 
 
 
452 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  53.03 
 
 
471 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  53.33 
 
 
454 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  54.04 
 
 
457 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  53.23 
 
 
459 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  53.3 
 
 
455 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  53.06 
 
 
470 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  52.03 
 
 
460 aa  485  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  52.47 
 
 
478 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  51.76 
 
 
455 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  53.47 
 
 
472 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  54.2 
 
 
478 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  53.56 
 
 
465 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  53.47 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  52.38 
 
 
456 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  53.24 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  53.24 
 
 
475 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  53.24 
 
 
475 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  53.24 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  53.02 
 
 
477 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  53.02 
 
 
476 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  52.35 
 
 
481 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  51.9 
 
 
482 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  51.95 
 
 
461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  48.53 
 
 
451 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  52.28 
 
 
464 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  51.73 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  52.06 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  52.06 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  52.68 
 
 
465 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  52.13 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  50.78 
 
 
480 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  51.01 
 
 
475 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  50.78 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  50.56 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  50.56 
 
 
477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  50.34 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  50.56 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  47.68 
 
 
460 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  52.12 
 
 
465 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  51.01 
 
 
466 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  47.24 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  50.67 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  46.26 
 
 
460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  49.22 
 
 
465 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  46.88 
 
 
463 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  47.3 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  47.17 
 
 
460 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  47.17 
 
 
460 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  46.94 
 
 
460 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  42.95 
 
 
443 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.58 
 
 
469 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.24 
 
 
465 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  45.19 
 
 
456 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.19 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  41.91 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.56 
 
 
459 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  40.75 
 
 
467 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  41.69 
 
 
456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  41.46 
 
 
456 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.63 
 
 
456 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  42.14 
 
 
460 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  42 
 
 
467 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.06 
 
 
468 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  40.72 
 
 
463 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  44.32 
 
 
456 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  42.13 
 
 
466 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.48 
 
 
467 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.83 
 
 
460 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  41.41 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  41.43 
 
 
459 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  42.76 
 
 
466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  42.58 
 
 
468 aa  339  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  42.54 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  42.54 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  40.85 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  42.32 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  42.32 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  42.89 
 
 
451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  41.26 
 
 
465 aa  336  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  39.51 
 
 
465 aa  335  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.25 
 
 
449 aa  335  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  41.19 
 
 
470 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  44.37 
 
 
463 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>