More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0191 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  93.42 
 
 
456 aa  878    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  100 
 
 
456 aa  936    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  99.78 
 
 
456 aa  934    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  61.73 
 
 
449 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  60.63 
 
 
456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  59.78 
 
 
455 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  57.59 
 
 
460 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  57.81 
 
 
460 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  58.22 
 
 
456 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  56.18 
 
 
459 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  56.03 
 
 
463 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  58.61 
 
 
468 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  55.97 
 
 
461 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  56.63 
 
 
456 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  52.13 
 
 
461 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  53.15 
 
 
459 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  51.77 
 
 
463 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  51.35 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  52.03 
 
 
485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  52.56 
 
 
458 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  50.9 
 
 
460 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  51.77 
 
 
463 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  54.03 
 
 
450 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  50.68 
 
 
462 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  48.08 
 
 
463 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  43.88 
 
 
467 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  46.71 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  44.59 
 
 
463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  44.03 
 
 
463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  43.48 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  47.25 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  46.27 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  47.47 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  46.27 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  46.05 
 
 
464 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  44.01 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  48.71 
 
 
450 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  44.4 
 
 
457 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  44.65 
 
 
463 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  44.66 
 
 
457 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  44.2 
 
 
465 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  45.05 
 
 
465 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  44.62 
 
 
458 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  45.18 
 
 
468 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  46.12 
 
 
459 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  43.85 
 
 
459 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  43.91 
 
 
468 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  42.44 
 
 
455 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.12 
 
 
466 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  43.45 
 
 
455 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  44.4 
 
 
457 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  43.08 
 
 
455 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  42.38 
 
 
454 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  42.22 
 
 
455 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  42 
 
 
455 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.2 
 
 
454 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  43.62 
 
 
459 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  41.5 
 
 
453 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  43.02 
 
 
460 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  41.02 
 
 
453 aa  382  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.6 
 
 
457 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.89 
 
 
453 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  42.66 
 
 
453 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  42.06 
 
 
453 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  41.1 
 
 
456 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  41.1 
 
 
456 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  43.56 
 
 
456 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.78 
 
 
460 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  42.49 
 
 
460 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.46 
 
 
457 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  42.2 
 
 
453 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  42.35 
 
 
457 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  39.37 
 
 
451 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.57 
 
 
456 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  43.59 
 
 
457 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.98 
 
 
452 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.5 
 
 
452 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  42.09 
 
 
455 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.87 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.04 
 
 
452 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  41.27 
 
 
459 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  42.18 
 
 
465 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40 
 
 
471 aa  353  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.69 
 
 
458 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  43.47 
 
 
451 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  41.95 
 
 
461 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  41.15 
 
 
464 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  41.95 
 
 
461 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  41.29 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  40.71 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  40.71 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  41.29 
 
 
475 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.31 
 
 
451 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  41.78 
 
 
466 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  40.85 
 
 
480 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  40.62 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  40.62 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  40.85 
 
 
480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  40.18 
 
 
481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  40.4 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>