More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6024 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  75.28 
 
 		 459 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  96.12 
 
 		 464 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  82 
 
 		 469 aa  798    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  98.28 
 
 		 464 aa  938    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  80.87 
 
 		 465 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  96.34 
 
 		 464 aa  901    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  96.12 
 
 		 464 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  96.54 
 
 		 464 aa  899    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  951    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  80.13 
 
 		 465 aa  781    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  61.26 
 
 		 468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  63.05 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  61.1 
 
 		 457 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  60.22 
 
 		 457 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  61.22 
 
 		 457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  60.81 
 
 		 457 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  59.39 
 
 		 458 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  60.13 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  59.09 
 
 		 459 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  59.12 
 
 		 459 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  60 
 
 		 456 aa  561  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  57.64 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  58.19 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  57.8 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  57.36 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  47.47 
 
 		 456 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  47.22 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  47.47 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  47.47 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  47.1 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  46.54 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  45.33 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  44.52 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  44.47 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  44.42 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  42.54 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  44.86 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  46.38 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  44.71 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  45.06 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  43.83 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  43.71 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  43.54 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.27 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  43.83 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  43.05 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  42.96 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  44.29 
 
 		 450 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  43.34 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  41.45 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.92 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  41.54 
 
 		 466 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  43.36 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  41.54 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  39.51 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.96 
 
 		 455 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.11 
 
 		 451 aa  353  5e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  40.92 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  41.59 
 
 		 457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.72 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  41.76 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  41.67 
 
 		 465 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  41.32 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  40.74 
 
 		 470 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.93 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  41.32 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  41.32 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  40.96 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.48 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  41.5 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.43 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.59 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.75 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  39.87 
 
 		 468 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  41.02 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  41.02 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  41.02 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.18 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  41.02 
 
 		 461 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  38.55 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.09 
 
 		 455 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  41.14 
 
 		 478 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.43 
 
 		 471 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  39.25 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  40.27 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.71 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>