More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2033 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  83.19 
 
 		 453 aa  794    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  94.51 
 
 		 455 aa  898    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  99.34 
 
 		 455 aa  939    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  73.79 
 
 		 453 aa  714    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  100 
 
 		 455 aa  942    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  66 
 
 		 457 aa  627  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  44.04 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  44.04 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  43.68 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  44.72 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  44.09 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  43.11 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  42 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  43.75 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  42 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  42.57 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  44.39 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.8 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  43.48 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  43.21 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  43.98 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  43.41 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.07 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.94 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  41.96 
 
 		 449 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  45.06 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  40.9 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  41.61 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  41.37 
 
 		 463 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  40.71 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  40.95 
 
 		 459 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  39.23 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  40.98 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  39.23 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  39.23 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.82 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  39.58 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.55 
 
 		 455 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.39 
 
 		 457 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.55 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.11 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 460 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.74 
 
 		 470 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  36.85 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.03 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  38.48 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.81 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  36.97 
 
 		 452 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.9 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.67 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  35.82 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.67 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.2 
 
 		 468 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.14 
 
 		 451 aa  305  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.14 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.25 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.25 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  36.53 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  36.88 
 
 		 450 aa  302  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.56 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  36.73 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.65 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  37.18 
 
 		 469 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.61 
 
 		 456 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  37.86 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.06 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  37.12 
 
 		 455 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.57 
 
 		 467 aa  286  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  36.68 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  33.26 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  37.5 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  36.5 
 
 		 464 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  36.5 
 
 		 464 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  35.01 
 
 		 457 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  34.36 
 
 		 457 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  33.93 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  34.59 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.81 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  36.14 
 
 		 464 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  35.87 
 
 		 464 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  35.43 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  35.65 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  34.1 
 
 		 459 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  36.2 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  38.17 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  35.13 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  38.64 
 
 		 465 aa  275  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  37.87 
 
 		 478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.66 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  35.21 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  35.29 
 
 		 465 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  37.32 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  35.13 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.32 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  35.49 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  36.74 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>