More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0161 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  949    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  53.81 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  51.89 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  51.99 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  52.43 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  52.65 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  54.04 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  50.43 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  49.78 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  49.78 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  49.78 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1858  hypothetical protein  49.78 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000249145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  41.93 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  43.96 
 
 		 467 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  43.74 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  43.38 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.2 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  43.02 
 
 		 460 aa  353  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.98 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  43.84 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.45 
 
 		 457 aa  349  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.45 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.45 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  42.23 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  43.36 
 
 		 454 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  41.88 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.51 
 
 		 459 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.23 
 
 		 452 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  41.52 
 
 		 478 aa  338  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  40.23 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.3 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  40 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  44.08 
 
 		 464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.43 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  40.78 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.03 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  39.64 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  40.69 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  41.03 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  41.03 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.23 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  39.96 
 
 		 478 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.14 
 
 		 453 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.14 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.42 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  40.18 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.14 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  39.73 
 
 		 472 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 465 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.54 
 
 		 451 aa  322  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  39.73 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  39.22 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  39.22 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  38.6 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  39.5 
 
 		 472 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  39.5 
 
 		 475 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  41.1 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  39.5 
 
 		 475 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 477 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  39.5 
 
 		 472 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  39.91 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  39.52 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.18 
 
 		 463 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  39.18 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.8 
 
 		 459 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  36.82 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.41 
 
 		 465 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  39.27 
 
 		 466 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  39.73 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  39.73 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  39.73 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.62 
 
 		 456 aa  309  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.92 
 
 		 463 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.42 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.86 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  36.93 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.2 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  37.96 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.6 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.6 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  40.76 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  40.3 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.53 
 
 		 456 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  39.37 
 
 		 458 aa  302  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  36.3 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.72 
 
 		 454 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  38.24 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>