More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4941 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  100 
 
 
452 aa  931    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  55.78 
 
 
461 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  41.42 
 
 
459 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.89 
 
 
458 aa  310  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.22 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.25 
 
 
471 aa  307  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  41.39 
 
 
454 aa  306  6e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38 
 
 
453 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38 
 
 
453 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.93 
 
 
457 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.47 
 
 
455 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.24 
 
 
453 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38 
 
 
453 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  38.24 
 
 
463 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.37 
 
 
452 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.21 
 
 
466 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.02 
 
 
452 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.2 
 
 
450 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.56 
 
 
452 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  36.73 
 
 
456 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  36.73 
 
 
456 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.53 
 
 
454 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.92 
 
 
457 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.04 
 
 
451 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.67 
 
 
449 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  36.64 
 
 
459 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  37.24 
 
 
459 aa  292  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.5 
 
 
467 aa  292  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  38.26 
 
 
464 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  40.69 
 
 
454 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  35.86 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  37.04 
 
 
460 aa  289  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  40.54 
 
 
479 aa  289  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.35 
 
 
460 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  36.08 
 
 
455 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  40.24 
 
 
449 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  39.12 
 
 
460 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  35.86 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  38.99 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.05 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.29 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.29 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.29 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.05 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.87 
 
 
470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.95 
 
 
451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  39.34 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  39.91 
 
 
465 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  39.31 
 
 
462 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.57 
 
 
446 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  37.17 
 
 
465 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  39.29 
 
 
449 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  36.28 
 
 
465 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.57 
 
 
446 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  41.13 
 
 
438 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.79 
 
 
456 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  39.72 
 
 
448 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.57 
 
 
443 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  37.03 
 
 
450 aa  276  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  38.6 
 
 
465 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37.25 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  37.58 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.03 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.25 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  36.18 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.03 
 
 
450 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  37.07 
 
 
478 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  40.51 
 
 
458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  37.36 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.03 
 
 
450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.12 
 
 
461 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  39.1 
 
 
454 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  37.95 
 
 
468 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.76 
 
 
458 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  37.03 
 
 
449 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  37.03 
 
 
450 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  39.95 
 
 
463 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  37.72 
 
 
465 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  34.91 
 
 
460 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  35.75 
 
 
461 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.58 
 
 
448 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.58 
 
 
448 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  37.88 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  37.88 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  37.86 
 
 
465 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  35.61 
 
 
470 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  38.86 
 
 
454 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  35.41 
 
 
456 aa  269  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.5 
 
 
455 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  38.41 
 
 
468 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  39.11 
 
 
458 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  37.31 
 
 
464 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  35.32 
 
 
470 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.11 
 
 
448 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>