More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1578 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  73.77 
 
 
457 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  72.77 
 
 
461 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  72.61 
 
 
454 aa  660    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  73.41 
 
 
462 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  74 
 
 
462 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  75.65 
 
 
460 aa  702    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  72.05 
 
 
458 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  73.09 
 
 
448 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  100 
 
 
458 aa  937    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  76.34 
 
 
464 aa  708    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  71.68 
 
 
461 aa  675    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  72.77 
 
 
461 aa  685    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  73.42 
 
 
456 aa  684    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  74.1 
 
 
448 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  71.62 
 
 
458 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  72.21 
 
 
459 aa  688    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  71.4 
 
 
461 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  78.81 
 
 
456 aa  720    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  72.21 
 
 
438 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  66.74 
 
 
463 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  68.09 
 
 
468 aa  621  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  66.96 
 
 
464 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  62.2 
 
 
460 aa  584  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  53.86 
 
 
464 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  53.32 
 
 
478 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  53.93 
 
 
454 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  48.12 
 
 
465 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  47.9 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  47.9 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  47.68 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  47.68 
 
 
465 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  47.68 
 
 
465 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  48.37 
 
 
462 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  46.22 
 
 
479 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  44.89 
 
 
451 aa  328  9e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  45.82 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  43.71 
 
 
448 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  43.71 
 
 
448 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  43.47 
 
 
448 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.95 
 
 
450 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.65 
 
 
456 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.65 
 
 
456 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  38.85 
 
 
455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  42.62 
 
 
451 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.97 
 
 
454 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.69 
 
 
455 aa  316  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.21 
 
 
457 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  43.95 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.73 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  44.34 
 
 
452 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.41 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.33 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.55 
 
 
453 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.33 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.55 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.27 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  39.55 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.85 
 
 
459 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  42.41 
 
 
455 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.74 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.88 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.53 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.92 
 
 
443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38.93 
 
 
449 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.04 
 
 
463 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.74 
 
 
470 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.93 
 
 
457 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.2 
 
 
446 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.95 
 
 
464 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  40.33 
 
 
446 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.65 
 
 
452 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  40.09 
 
 
446 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.96 
 
 
471 aa  299  9e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  40.14 
 
 
446 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.92 
 
 
456 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.51 
 
 
458 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  38.7 
 
 
449 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  40.33 
 
 
458 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  39.25 
 
 
456 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.73 
 
 
446 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.73 
 
 
446 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.73 
 
 
446 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.02 
 
 
456 aa  295  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.37 
 
 
460 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.32 
 
 
456 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  41.45 
 
 
459 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  40.99 
 
 
467 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  39.07 
 
 
450 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.05 
 
 
460 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  37.72 
 
 
459 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.2 
 
 
451 aa  292  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  40.55 
 
 
468 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.05 
 
 
457 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.44 
 
 
467 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>