More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0821 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  66.59 
 
 
454 aa  643    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  84.18 
 
 
464 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  71.9 
 
 
462 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  70.87 
 
 
462 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  69.4 
 
 
461 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  74.13 
 
 
458 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  71.93 
 
 
458 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  70.58 
 
 
461 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  70.07 
 
 
461 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  71.05 
 
 
457 aa  656    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  74.1 
 
 
456 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  75.65 
 
 
458 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  70.07 
 
 
461 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  72.38 
 
 
448 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  100 
 
 
460 aa  948    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  75.5 
 
 
456 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  71.37 
 
 
448 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  70.87 
 
 
459 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  67.93 
 
 
468 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  63.88 
 
 
463 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  69.32 
 
 
438 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  67.34 
 
 
464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  60.98 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  54.61 
 
 
464 aa  507  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  51.33 
 
 
478 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  50.79 
 
 
454 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  48.15 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  47.93 
 
 
465 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  47.49 
 
 
465 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  47.93 
 
 
465 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  47.71 
 
 
465 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  47.93 
 
 
465 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  48.16 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  47.35 
 
 
479 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.53 
 
 
451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  43.3 
 
 
449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.55 
 
 
455 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  41.44 
 
 
443 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  42.21 
 
 
450 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.93 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.61 
 
 
456 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.61 
 
 
456 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.67 
 
 
455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.36 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.22 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.57 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.82 
 
 
448 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.82 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.82 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.17 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.12 
 
 
466 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.22 
 
 
454 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.17 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.82 
 
 
456 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.26 
 
 
464 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.12 
 
 
452 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.86 
 
 
458 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  41.01 
 
 
470 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.73 
 
 
453 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.16 
 
 
453 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.89 
 
 
452 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  40.78 
 
 
470 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.55 
 
 
470 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  43.53 
 
 
452 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.18 
 
 
460 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.76 
 
 
457 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.44 
 
 
452 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  38.1 
 
 
449 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  40.46 
 
 
461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  38.1 
 
 
449 aa  289  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  38.32 
 
 
450 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  38.1 
 
 
449 aa  289  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  37.89 
 
 
450 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.53 
 
 
449 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  37.87 
 
 
449 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  38.01 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.23 
 
 
478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.41 
 
 
471 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  40.1 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.16 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.47 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  38.36 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  37.56 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  36.97 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.25 
 
 
450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  37.99 
 
 
450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  39.27 
 
 
467 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.93 
 
 
451 aa  283  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.55 
 
 
467 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.77 
 
 
459 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.8 
 
 
449 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  37.19 
 
 
446 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.8 
 
 
449 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.8 
 
 
449 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.8 
 
 
449 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.13 
 
 
468 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.8 
 
 
449 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.49 
 
 
446 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>