More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4687 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  89.89 
 
 		 449 aa  842    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  89.89 
 
 		 449 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  90.11 
 
 		 449 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  96.86 
 
 		 446 aa  892    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  68.24 
 
 		 448 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  89.69 
 
 		 449 aa  841    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  89.89 
 
 		 449 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  96.41 
 
 		 446 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  68.24 
 
 		 448 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  94.39 
 
 		 446 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  89.89 
 
 		 449 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  89.89 
 
 		 449 aa  842    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  98.88 
 
 		 446 aa  909    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  96.41 
 
 		 446 aa  888    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  68.24 
 
 		 448 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  89.89 
 
 		 449 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  96.41 
 
 		 446 aa  888    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  59.02 
 
 		 454 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  58.78 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  54.88 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  51.47 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  51.7 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  49.66 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  48.86 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  47.95 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.99 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.69 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.63 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.32 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.95 
 
 		 451 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  42.66 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  41.38 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.76 
 
 		 454 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.28 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  40 
 
 		 455 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.92 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.47 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.28 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.39 
 
 		 459 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.72 
 
 		 455 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 453 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.81 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.41 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.86 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  39.31 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.41 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.41 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  39.06 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.15 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2166  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.64 
 
 		 455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.39 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.71 
 
 		 478 aa  312  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  38.37 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.27 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  39.06 
 
 		 459 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  41.37 
 
 		 452 aa  309  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.7 
 
 		 471 aa  309  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.95 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.41 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  38.17 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  39.64 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.41 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  36.72 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.39 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  38.27 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  37.72 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  38.01 
 
 		 470 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.59 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.26 
 
 		 468 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0070  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.72 
 
 		 462 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275257  normal  0.0217188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.44 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  38.72 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  38.75 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  37.79 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.43 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  40.23 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  35.39 
 
 		 446 aa  302  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  40.05 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  36.88 
 
 		 452 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  36.65 
 
 		 452 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  41.55 
 
 		 459 aa  302  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  38.36 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  36.89 
 
 		 449 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  36.67 
 
 		 449 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  37.92 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  36.65 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  36.67 
 
 		 449 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  36.67 
 
 		 449 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  36.67 
 
 		 450 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  38.18 
 
 		 456 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  36.44 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  39.35 
 
 		 442 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1122  beta alanine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.456667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  40.42 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  36.67 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  38.85 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>