More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2911 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  924    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  54.5 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  53.93 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  50.66 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  51.95 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  51.24 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  49.43 
 
 		 448 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  49.66 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  50.79 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  48.97 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  49.21 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  50.12 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  50.12 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  50.12 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  50.59 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  50.24 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  51.39 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  50.95 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  51.54 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  46.09 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  50 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  50.11 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  48.65 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  50.71 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  45.84 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  46.61 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  49.06 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  45.93 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  45.93 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  45.93 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  45.56 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  46.5 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  46.12 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  44.1 
 
 		 479 aa  358  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  44.44 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  39.91 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.82 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.99 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  39.19 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.22 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.91 
 
 		 455 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 466 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 478 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  40.52 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  40.71 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  38.06 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.86 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.34 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.04 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 454 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 455 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  41.18 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.55 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  36.3 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  36.57 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.21 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  36.53 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.21 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.55 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  39.66 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  36.53 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.87 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.87 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  36.3 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  36.3 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  38.98 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.6 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  36.34 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.51 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.67 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  40.68 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.14 
 
 		 451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.5 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  40.44 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.04 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.85 
 
 		 471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.04 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.04 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.1 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 446 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3022  beta alanine--pyruvate transaminase  36 
 
 		 450 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.12 
 
 		 446 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  37.44 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  37.41 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  37.78 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  35.44 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.36 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  35.67 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.59 
 
 		 453 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.86 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>