More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0950 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  69.44 
 
 		 454 aa  640    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  71.37 
 
 		 460 aa  661    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  68.09 
 
 		 462 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  912    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  90.4 
 
 		 448 aa  823    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  73.09 
 
 		 458 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  73.66 
 
 		 459 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  68.08 
 
 		 457 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  68.22 
 
 		 458 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  74.38 
 
 		 456 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  71.68 
 
 		 464 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  69.27 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  67.41 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  67.48 
 
 		 461 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  67.26 
 
 		 461 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  67.48 
 
 		 461 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  68.6 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  67.26 
 
 		 461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  62.95 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  64.33 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  64.79 
 
 		 464 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  61.21 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  65.75 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  54.26 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  50.23 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  47.19 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  46.97 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  46.74 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  46.74 
 
 		 465 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  48.3 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  46.52 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  46.52 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  48.75 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  47.89 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  44.08 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  43.54 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.95 
 
 		 451 aa  316  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  43.3 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  43.3 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.86 
 
 		 455 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.62 
 
 		 454 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.9 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  40.36 
 
 		 450 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  39.2 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.39 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  42.42 
 
 		 450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.75 
 
 		 456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.96 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  41.22 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.37 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.19 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  42.42 
 
 		 450 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.79 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.48 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.48 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.48 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.29 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.19 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  38.72 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.59 
 
 		 478 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.83 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  39.81 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  39.57 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  39.57 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  39.57 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  39.34 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.95 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  38.95 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  39.29 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  39.34 
 
 		 449 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  39.34 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.98 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.95 
 
 		 457 aa  292  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.95 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.29 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.52 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.71 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.71 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  41.9 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.47 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.64 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  39.67 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  42.74 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.74 
 
 		 471 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.13 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.79 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.14 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  35.8 
 
 		 466 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.91 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.22 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  38.3 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  40.05 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>