More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4297 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  68.24 
 
 
449 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  68.24 
 
 
446 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  69.14 
 
 
446 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  68.02 
 
 
449 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  68.02 
 
 
446 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  68.24 
 
 
449 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  68.69 
 
 
449 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  68.24 
 
 
446 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  68.24 
 
 
449 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  67.79 
 
 
449 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  68.24 
 
 
446 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  99.55 
 
 
448 aa  909    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  68.24 
 
 
449 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  68.02 
 
 
446 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  68.24 
 
 
449 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  99.55 
 
 
448 aa  909    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  68.24 
 
 
446 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  914    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  54.34 
 
 
454 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  54.11 
 
 
454 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  54 
 
 
456 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  48.65 
 
 
448 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  48.49 
 
 
451 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  47.1 
 
 
452 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  43.79 
 
 
455 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  42.92 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.96 
 
 
449 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.78 
 
 
451 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.02 
 
 
450 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.6 
 
 
454 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.09 
 
 
451 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  43.43 
 
 
479 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.36 
 
 
464 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  43.54 
 
 
448 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  40.56 
 
 
467 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  39.15 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  38.93 
 
 
459 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  39.6 
 
 
457 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  43.54 
 
 
459 aa  316  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  39.2 
 
 
450 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.83 
 
 
465 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  39.2 
 
 
449 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.93 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  38.98 
 
 
449 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  43.84 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  38.75 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  38.75 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  38.75 
 
 
450 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  38.7 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.97 
 
 
451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  38.53 
 
 
450 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.48 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.33 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  40.28 
 
 
459 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  38.53 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  38.53 
 
 
450 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.5 
 
 
459 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.93 
 
 
457 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.14 
 
 
478 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.5 
 
 
463 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  38.31 
 
 
450 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.44 
 
 
466 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.76 
 
 
454 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.72 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  44.17 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.74 
 
 
455 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.3 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  39.04 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.3 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  41.13 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.06 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.1 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.1 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  41.57 
 
 
456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2166  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  40.77 
 
 
455 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  39.13 
 
 
456 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.06 
 
 
453 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  40.05 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  40.48 
 
 
455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  41.78 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  38.91 
 
 
468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  40.05 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  37.72 
 
 
469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  40.05 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.66 
 
 
471 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  40.9 
 
 
457 aa  306  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  40.32 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  42 
 
 
463 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.48 
 
 
460 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.61 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  40.14 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.41 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.39 
 
 
456 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.57 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  37.73 
 
 
460 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  38.18 
 
 
468 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.5 
 
 
455 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.66 
 
 
456 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.44 
 
 
458 aa  299  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  41.47 
 
 
458 aa  299  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>