More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0161 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  900    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  69.25 
 
 		 442 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  66.29 
 
 		 444 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  67.65 
 
 		 442 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  67.43 
 
 		 442 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  64.92 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  61.7 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  61.7 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  61.7 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  61.68 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  61.93 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  61.7 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  61.7 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  61.45 
 
 		 445 aa  554  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  62.73 
 
 		 440 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  61.68 
 
 		 444 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  61.47 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  61.68 
 
 		 444 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  61.54 
 
 		 442 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  61.47 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  61.68 
 
 		 444 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  61.45 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  61.54 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  61.22 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  61.22 
 
 		 444 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  61.96 
 
 		 441 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  60.27 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  62.18 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  61.25 
 
 		 443 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  61.38 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  58.82 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  59.31 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  60.69 
 
 		 451 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  60.32 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  59.27 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  59.63 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  60 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  56.06 
 
 		 443 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  55.7 
 
 		 447 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  55.86 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.09 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  46.4 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  42.93 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  43.97 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  44.52 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  45.56 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.69 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  40.93 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  38.59 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  40.47 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.44 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  43.02 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  40.75 
 
 		 465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  38.18 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  39.48 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.82 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.01 
 
 		 446 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.18 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.18 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.18 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  41.19 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  41.19 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  40.28 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  41.19 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  37.65 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.64 
 
 		 446 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.38 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  40.48 
 
 		 465 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.1 
 
 		 449 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  37.18 
 
 		 436 aa  275  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.53 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  40.05 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.71 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.95 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  37.95 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  38.43 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  37.18 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  37.56 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  37.89 
 
 		 464 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  37.09 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.63 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  38.71 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.03 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1328  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.67 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  38.17 
 
 		 456 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  35.44 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>