More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4437 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  81.74 
 
 
452 aa  749    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  927    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  65.32 
 
 
455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  65.19 
 
 
447 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  55.68 
 
 
448 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  50.23 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  49.77 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  48.64 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  48.86 
 
 
446 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  48.64 
 
 
446 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  48.86 
 
 
446 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  48.64 
 
 
446 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  48.64 
 
 
446 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  49.55 
 
 
446 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  48.49 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  48.49 
 
 
448 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  48.49 
 
 
448 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  45.5 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  43.6 
 
 
454 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  43.37 
 
 
454 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.15 
 
 
454 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.08 
 
 
449 aa  324  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.96 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.16 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.32 
 
 
451 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.11 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  37.7 
 
 
466 aa  299  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.01 
 
 
443 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  38.3 
 
 
466 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.12 
 
 
453 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.5 
 
 
453 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  38.3 
 
 
466 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  38.53 
 
 
466 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  38.53 
 
 
466 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  38.53 
 
 
466 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  36.7 
 
 
458 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  35.87 
 
 
465 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.89 
 
 
453 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.83 
 
 
455 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.32 
 
 
458 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  36.45 
 
 
457 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.08 
 
 
455 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  37.95 
 
 
464 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  36.68 
 
 
456 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.1 
 
 
451 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  36.68 
 
 
456 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  35.96 
 
 
459 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  36.18 
 
 
454 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  36.34 
 
 
454 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  36.36 
 
 
457 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  35.81 
 
 
465 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  37.81 
 
 
457 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.01 
 
 
470 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  36.68 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  35.32 
 
 
469 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  34.72 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  36.9 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.1 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  35.21 
 
 
459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  37.53 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  34.82 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  35.78 
 
 
463 aa  283  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  37.39 
 
 
469 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  37.75 
 
 
473 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  37.27 
 
 
478 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  35.75 
 
 
452 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  34.72 
 
 
460 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  38.24 
 
 
458 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  38.46 
 
 
454 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  36.21 
 
 
452 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  39.28 
 
 
465 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  38.46 
 
 
454 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  38.46 
 
 
454 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  38.58 
 
 
466 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  35.76 
 
 
458 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  37.33 
 
 
455 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  34.91 
 
 
450 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  38.46 
 
 
465 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.81 
 
 
471 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  38.46 
 
 
454 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  38.83 
 
 
465 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  39.05 
 
 
465 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  39.05 
 
 
465 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  37.87 
 
 
457 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  35.97 
 
 
459 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  37.08 
 
 
473 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  37.08 
 
 
473 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  35.71 
 
 
460 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  35.94 
 
 
460 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  37.08 
 
 
473 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  37.1 
 
 
455 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  33.78 
 
 
456 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.32 
 
 
466 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  38.24 
 
 
465 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>