More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2912 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  78.56 
 
 		 458 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  80.31 
 
 		 458 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  81.58 
 
 		 458 aa  780    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  82.02 
 
 		 458 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  81.84 
 
 		 457 aa  754    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  923    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  82.02 
 
 		 458 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  59.61 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  61.4 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  62.88 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  63.1 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  62.77 
 
 		 466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  63.1 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  63.1 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  62.88 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  61.83 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  62.56 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  63.66 
 
 		 465 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  60.31 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  63.1 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  58.33 
 
 		 458 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  61.67 
 
 		 467 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  63.13 
 
 		 469 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  45.29 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  46.59 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  44.24 
 
 		 455 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  44.24 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  44.49 
 
 		 453 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.57 
 
 		 466 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  44.02 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  44.02 
 
 		 453 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  43.47 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  43.47 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  41.59 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  43.21 
 
 		 454 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 452 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.25 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  41.56 
 
 		 470 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.16 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.53 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  43.56 
 
 		 460 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.53 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  41.28 
 
 		 470 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  42.53 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  43.33 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.53 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  40.89 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  41.11 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  42.16 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  42.29 
 
 		 456 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  43.18 
 
 		 465 aa  336  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  42.89 
 
 		 468 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  41.94 
 
 		 457 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  43.23 
 
 		 457 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.11 
 
 		 450 aa  332  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  42.32 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  40.36 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.73 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  40.92 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  40.31 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.43 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  41.54 
 
 		 457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.72 
 
 		 451 aa  329  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.08 
 
 		 456 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  43.19 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  39.78 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.87 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  40.7 
 
 		 468 aa  325  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  41.44 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.67 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  41.63 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 478 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.27 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.34 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 461 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  42.54 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  39.6 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  41.31 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  37.74 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  41.7 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.54 
 
 		 449 aa  316  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  41.7 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 460 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  41.48 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  39.15 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  41.44 
 
 		 461 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.33 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.91 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  40.99 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  40.99 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  40.99 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  41.67 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.77 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 477 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>