More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1920 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  78.34 
 
 		 457 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  81.4 
 
 		 458 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  79.43 
 
 		 458 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  76.81 
 
 		 458 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  80.31 
 
 		 457 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  929    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  81.84 
 
 		 458 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  61 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  61 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  61 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  57.3 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  59.21 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  60.57 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  60.57 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  59.69 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  60.92 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  62.33 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  56.7 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  59.34 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  60.7 
 
 		 465 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  59.47 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  56.46 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  58.68 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  44.82 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.73 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.76 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  43.12 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.82 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.91 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  42.38 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.43 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.5 
 
 		 458 aa  332  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.7 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.91 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.64 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.04 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.31 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  40.75 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  41.53 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  41.53 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  42 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.84 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  42.19 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.78 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.16 
 
 		 469 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  40.18 
 
 		 457 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.99 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.37 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  39.87 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  40.79 
 
 		 456 aa  320  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.22 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40.98 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.21 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  39.24 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  40.67 
 
 		 468 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.69 
 
 		 463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  39.38 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.06 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  38.39 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  38.11 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  39 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  37.67 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  37.28 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  39.95 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.17 
 
 		 467 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.39 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  40.09 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.57 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  37.53 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  40 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  40 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  39.95 
 
 		 463 aa  302  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.79 
 
 		 456 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  37.69 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.34 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  37.59 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.55 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  37.92 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  37.47 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.95 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  36.38 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.72 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  39.55 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  36.16 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  37.25 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  37.25 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  38.79 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  38.79 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.55 
 
 		 464 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  38.79 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  37.69 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.33 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  36.97 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>