More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0052 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  74.84 
 
 
467 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  69.15 
 
 
466 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  69.15 
 
 
466 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  79.34 
 
 
467 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  69.58 
 
 
466 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  71.96 
 
 
469 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  939    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  72.81 
 
 
465 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  70.9 
 
 
466 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  69.58 
 
 
459 aa  670    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  69.15 
 
 
466 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  72.25 
 
 
465 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  69.15 
 
 
466 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  63.88 
 
 
466 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  59.65 
 
 
457 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  57.05 
 
 
458 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  56.89 
 
 
458 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  57.46 
 
 
458 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  60.31 
 
 
457 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  57.81 
 
 
452 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  57.24 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  58.33 
 
 
458 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  56.46 
 
 
458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.72 
 
 
459 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.26 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.13 
 
 
456 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.52 
 
 
460 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.16 
 
 
455 aa  345  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.66 
 
 
470 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.32 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.27 
 
 
456 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.27 
 
 
456 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  41.39 
 
 
465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  40.41 
 
 
457 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.25 
 
 
454 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41 
 
 
457 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40 
 
 
454 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.67 
 
 
456 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.64 
 
 
455 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  39.69 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  39.69 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.47 
 
 
468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.22 
 
 
467 aa  326  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  39.69 
 
 
464 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  37.61 
 
 
459 aa  325  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.98 
 
 
453 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  39.37 
 
 
453 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  39.69 
 
 
464 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.75 
 
 
453 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.98 
 
 
453 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  39.08 
 
 
457 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.15 
 
 
452 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.29 
 
 
463 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.73 
 
 
451 aa  322  9.000000000000001e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  39.25 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.11 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  37.95 
 
 
461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  38.36 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  39.46 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  39.96 
 
 
456 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.31 
 
 
470 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.26 
 
 
452 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.02 
 
 
460 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  39.25 
 
 
464 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.36 
 
 
443 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.7 
 
 
452 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  38.79 
 
 
485 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.84 
 
 
451 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.31 
 
 
470 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  38.18 
 
 
468 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.31 
 
 
470 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  39.22 
 
 
457 aa  315  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  39.17 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.16 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  37.89 
 
 
460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  39.01 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.69 
 
 
458 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.97 
 
 
460 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  37.64 
 
 
451 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.22 
 
 
465 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  39.14 
 
 
458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  36.79 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  37.55 
 
 
457 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  37.09 
 
 
461 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  38.2 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  38.84 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.08 
 
 
466 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  37.67 
 
 
463 aa  306  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  36.08 
 
 
455 aa  306  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  37.99 
 
 
460 aa  306  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.33 
 
 
455 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  35.92 
 
 
471 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.4 
 
 
467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  39.55 
 
 
455 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  37.55 
 
 
459 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  37.34 
 
 
459 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  37.86 
 
 
456 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  36.38 
 
 
450 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  37.78 
 
 
465 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  34.79 
 
 
468 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>