More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5668 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  932    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  80.7 
 
 		 458 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  78.34 
 
 		 458 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  81.84 
 
 		 457 aa  730    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  76.81 
 
 		 458 aa  705    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  81.8 
 
 		 458 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  80.92 
 
 		 458 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  59.83 
 
 		 459 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  61.35 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  60.22 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  61.14 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  60.92 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  61.01 
 
 		 467 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  60.92 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  59.65 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  60.48 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  60.92 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  61.49 
 
 		 465 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  62.91 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  60.8 
 
 		 452 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  61.27 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  57.46 
 
 		 458 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  60.13 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  43.86 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.44 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.26 
 
 		 460 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  43.12 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  42.66 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  42.76 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.21 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  42.66 
 
 		 453 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 451 aa  342  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  40.52 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.27 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.86 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.68 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.68 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.18 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.89 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.11 
 
 		 470 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.56 
 
 		 469 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.89 
 
 		 470 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  39.11 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.4 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.95 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.18 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.68 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  41.27 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  40.18 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  40.59 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.07 
 
 		 470 aa  326  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  40.44 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.96 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.99 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.04 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.27 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.93 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40.99 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.06 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  40.53 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.06 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  39.6 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  39.82 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  39.55 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.7 
 
 		 455 aa  320  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.29 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  39.6 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  38.94 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  38.94 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  38.94 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  40.13 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  38.5 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  39.25 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.14 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  39.29 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.33 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.92 
 
 		 467 aa  312  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  40.88 
 
 		 450 aa  312  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  38.03 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  38.01 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.36 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  39.95 
 
 		 454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  40.27 
 
 		 465 aa  309  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  37.72 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.03 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  40.62 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.12 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  40.35 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  39.19 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  38.62 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>