More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3803 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  879    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  90.95 
 
 		 442 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  98.64 
 
 		 442 aa  870    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  71.04 
 
 		 444 aa  627  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  70.07 
 
 		 444 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  67.43 
 
 		 442 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  66.82 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  66.29 
 
 		 447 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  67.06 
 
 		 441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  66.36 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  66.82 
 
 		 443 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  63.24 
 
 		 445 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  64.38 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  64.16 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  63.7 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  63.93 
 
 		 442 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  64.52 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  63.24 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  63.47 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  63.51 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  63.47 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  63.47 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  63.24 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  63.05 
 
 		 448 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  63.66 
 
 		 446 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  63.33 
 
 		 441 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  61.96 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  61.96 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  62.82 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  61.54 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  63.68 
 
 		 451 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  64.2 
 
 		 451 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  63.51 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  58.66 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  49 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  46.41 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  45.15 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  46.26 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  43.03 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  43.32 
 
 		 455 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  42.52 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  43.51 
 
 		 451 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  44.72 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  39.81 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  42.32 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  41.2 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  40.58 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  42.41 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.88 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  41.76 
 
 		 459 aa  295  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  40.4 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  42.26 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  41.97 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  40 
 
 		 461 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  40 
 
 		 461 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  41.07 
 
 		 462 aa  292  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  41.53 
 
 		 461 aa  292  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  41.44 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  42.35 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  41.02 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  40.4 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  39.55 
 
 		 461 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  39.65 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  41.8 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  40.22 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  43.05 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1328  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  40.88 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.72 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.72 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.72 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.48 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  36.62 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  40.28 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  38.99 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.95 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  40.19 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  36.15 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.72 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  36.62 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  35.92 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  40.05 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  40.32 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  39.54 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  39.72 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.17 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.64 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.8 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>