More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1190 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1190  aminotransferase class-III  100 
 
 		 417 aa  822    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5404  aminotransferase class-III  54.03 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254649  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3064  aminotransferase class-III  52.17 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2631  aminotransferase class-III  52.66 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.445972  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2295  aminotransferase class-III  47.47 
 
 		 422 aa  345  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4579  aminotransferase class-III  45.04 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1812  aminotransferase class-III  44.07 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2226  aminotransferase class-III  45.19 
 
 		 414 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  41.61 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  41.43 
 
 		 456 aa  292  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  41.42 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.69 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.42 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  40.64 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.5 
 
 		 478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.04 
 
 		 471 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.46 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  40.97 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.12 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  40.55 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  43.27 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  39.26 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  38.02 
 
 		 455 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 466 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  38.46 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.23 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  40.38 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.23 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.23 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.23 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.73 
 
 		 446 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  40.05 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.62 
 
 		 453 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.38 
 
 		 453 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  43.1 
 
 		 458 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.46 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.62 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  39.5 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.59 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.68 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.68 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.68 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.68 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.68 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.68 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.83 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  39.68 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.73 
 
 		 448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  38.07 
 
 		 455 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.73 
 
 		 448 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.73 
 
 		 448 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.08 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  36.59 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.15 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  40.14 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.58 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.5 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  39.59 
 
 		 479 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  39.45 
 
 		 449 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  37.41 
 
 		 449 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  39.44 
 
 		 457 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  38.71 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  39.3 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  37.99 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  41.67 
 
 		 460 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  38.27 
 
 		 463 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.09 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  38.69 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  40.89 
 
 		 460 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.28 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.24 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  37.44 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.41 
 
 		 451 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.19 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.7 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  37.87 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  40 
 
 		 464 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.94 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  38.3 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  38.3 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.6 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  38.77 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  36.71 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  36.99 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  36.74 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  36.74 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.75 
 
 		 467 aa  259  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  36.57 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.79 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  36.24 
 
 		 456 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  38.51 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.2 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.2 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>