More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1705 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  83.48 
 
 
444 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  894    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  73.18 
 
 
446 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  75.93 
 
 
446 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  80.27 
 
 
447 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.02 
 
 
447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  63.39 
 
 
440 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  63.66 
 
 
443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  65.3 
 
 
441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  65.9 
 
 
450 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  63.16 
 
 
444 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  62.25 
 
 
445 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  63.16 
 
 
444 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  63.16 
 
 
444 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  63.39 
 
 
444 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  63.51 
 
 
451 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  62.76 
 
 
442 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  64.52 
 
 
451 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  62.01 
 
 
444 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  62.01 
 
 
444 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  63.19 
 
 
443 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  62.01 
 
 
444 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  63.08 
 
 
442 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  63.24 
 
 
441 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  61.61 
 
 
448 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  64.27 
 
 
441 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  61.15 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  62.59 
 
 
442 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  62.82 
 
 
442 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  62.36 
 
 
442 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  59.05 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  54.57 
 
 
443 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  55.86 
 
 
442 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  55.84 
 
 
444 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  50.57 
 
 
447 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.25 
 
 
448 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  47.07 
 
 
461 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  46.62 
 
 
442 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  43.84 
 
 
451 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  40.58 
 
 
469 aa  309  5e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.55 
 
 
455 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  41.94 
 
 
470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  36.79 
 
 
451 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.57 
 
 
465 aa  280  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  34.03 
 
 
459 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.8 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  38.26 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  37.92 
 
 
461 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  39.59 
 
 
456 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  38.48 
 
 
464 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.47 
 
 
458 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  39.25 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  37.44 
 
 
461 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  37.44 
 
 
461 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  37.14 
 
 
461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  37.05 
 
 
462 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  36.84 
 
 
456 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  39.9 
 
 
465 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  36.9 
 
 
468 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  39.21 
 
 
465 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  36.28 
 
 
458 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  39.21 
 
 
465 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  39.42 
 
 
465 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  38.08 
 
 
457 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  39.21 
 
 
465 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.19 
 
 
456 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  39.77 
 
 
444 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  37.18 
 
 
464 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  32.82 
 
 
446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  39.17 
 
 
465 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  36.58 
 
 
454 aa  258  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  37.91 
 
 
438 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  36.62 
 
 
448 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  35.51 
 
 
454 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  36.59 
 
 
460 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  36.64 
 
 
448 aa  256  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.2 
 
 
448 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.2 
 
 
448 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.2 
 
 
448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  35.94 
 
 
467 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  37.35 
 
 
456 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  41.51 
 
 
437 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  39.52 
 
 
462 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  37.62 
 
 
463 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  38.52 
 
 
453 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  35.35 
 
 
465 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  37.5 
 
 
464 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  35.27 
 
 
450 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>