More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0176 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  77.6 
 
 
443 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  77.37 
 
 
443 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  75.17 
 
 
447 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  892    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  66.51 
 
 
448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  66.29 
 
 
442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  66.06 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  66.06 
 
 
444 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  66.06 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  65.83 
 
 
444 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  66.06 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  66.06 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  66.06 
 
 
444 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  65.15 
 
 
445 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  65.6 
 
 
448 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  65.38 
 
 
444 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  65.6 
 
 
444 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  65.6 
 
 
448 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  65.15 
 
 
444 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  65.83 
 
 
448 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  65.15 
 
 
444 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  64.69 
 
 
442 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  67.75 
 
 
441 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  67.51 
 
 
451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  66.82 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  64.99 
 
 
444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  67.13 
 
 
451 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  64.61 
 
 
446 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  66.12 
 
 
444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  65.98 
 
 
450 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  63.39 
 
 
447 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  66.82 
 
 
442 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  63.78 
 
 
441 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  64.01 
 
 
441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  66.36 
 
 
442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  66.13 
 
 
442 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.3 
 
 
447 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  62.73 
 
 
442 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  57.54 
 
 
443 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  57.99 
 
 
444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  49.89 
 
 
447 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.05 
 
 
448 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  46.42 
 
 
461 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  43.81 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  43.88 
 
 
470 aa  328  8e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  41.69 
 
 
469 aa  327  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  40.56 
 
 
451 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  36.73 
 
 
459 aa  319  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.33 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  43.02 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  41.69 
 
 
453 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.81 
 
 
449 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  39.62 
 
 
446 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.48 
 
 
459 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.76 
 
 
444 aa  285  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.66 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  38.68 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.44 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.44 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.44 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.21 
 
 
446 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.83 
 
 
468 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39 
 
 
446 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.9 
 
 
451 aa  280  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.04 
 
 
449 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  35.47 
 
 
436 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.88 
 
 
456 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.4 
 
 
465 aa  277  3e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.15 
 
 
471 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.83 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  35.24 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.83 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.93 
 
 
458 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.61 
 
 
448 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  37.53 
 
 
458 aa  272  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  40.33 
 
 
438 aa  272  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  37.7 
 
 
468 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  36.68 
 
 
451 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2818  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.6 
 
 
478 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3049  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.48 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.72 
 
 
459 aa  270  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  36.02 
 
 
463 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.35 
 
 
456 aa  269  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.19 
 
 
454 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>