More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0082 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  75.4 
 
 		 445 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  903    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  73.56 
 
 		 448 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  73.79 
 
 		 448 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  75.28 
 
 		 444 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  73.79 
 
 		 448 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  77.06 
 
 		 441 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  73.56 
 
 		 448 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  90 
 
 		 451 aa  799    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  75.28 
 
 		 444 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  91.82 
 
 		 451 aa  798    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  74.94 
 
 		 442 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  76.42 
 
 		 444 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  76.87 
 
 		 444 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  74.71 
 
 		 448 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  74.72 
 
 		 442 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  76.55 
 
 		 441 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  73.79 
 
 		 448 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  75.74 
 
 		 444 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  75.28 
 
 		 444 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  73.79 
 
 		 448 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  75.51 
 
 		 444 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  73.79 
 
 		 448 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  66.22 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.84 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  66.82 
 
 		 446 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  66.13 
 
 		 440 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  65.07 
 
 		 444 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  65.09 
 
 		 447 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  66.2 
 
 		 443 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  65.28 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  63.9 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  60.91 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  65.68 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  63.95 
 
 		 441 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  63.16 
 
 		 442 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  63.39 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  60.87 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  58.53 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  55.58 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  50.35 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  48.53 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  46.94 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  42.99 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  43.02 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  43.36 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  41.28 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  41.87 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.72 
 
 		 444 aa  296  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  36.41 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  43.56 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  39.29 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.27 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  40.72 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  40.71 
 
 		 459 aa  276  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  39.48 
 
 		 456 aa  273  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  38.85 
 
 		 458 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.31 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.47 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.47 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.67 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.38 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.29 
 
 		 451 aa  269  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  40.38 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  39.54 
 
 		 462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.2 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.26 
 
 		 459 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  39.81 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  35.51 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  37.99 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.73 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.73 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  39.23 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.5 
 
 		 461 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  35.28 
 
 		 436 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  38.35 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.34 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  35.85 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  39.03 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  35.05 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  35.28 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.3 
 
 		 470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  39.95 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  41.67 
 
 		 462 aa  259  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  39.15 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.58 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  37.95 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  38.1 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.62 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  39.72 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  37.5 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  37.9 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  37.27 
 
 		 468 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.15 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>