More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1177 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  100 
 
 		 444 aa  878    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  43.79 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  45.56 
 
 		 442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  43.86 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  42.38 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  41.89 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  41.89 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  41.12 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  41.14 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  42.21 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  42.01 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  45.64 
 
 		 442 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  45.64 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  41.99 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  45.41 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  41.22 
 
 		 444 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  40.09 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  43.53 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  42.92 
 
 		 440 aa  303  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  39.86 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  41.82 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  39.08 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  41.32 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  41.76 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  43.93 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  39.63 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  43.5 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  43.57 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.82 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  41.67 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  42.28 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  42.66 
 
 		 451 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  42.04 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.59 
 
 		 443 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  42.53 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  38.48 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  41.76 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  40.77 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  41.82 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  40.85 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  40.05 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  40 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  39.91 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.77 
 
 		 451 aa  261  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  35.24 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  38.68 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  38.08 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  35.43 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  37 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  35.94 
 
 		 456 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.14 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.14 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  37.91 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  42.92 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  38.93 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  39.25 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  34.99 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  36.99 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  39.77 
 
 		 460 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  38 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.48 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  37.67 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  36.32 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.41 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.41 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  37.62 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  37.06 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  36.09 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  36.09 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  36.09 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  36.09 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  36.09 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  39.37 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  36.09 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  35.36 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  36.09 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  35.63 
 
 		 450 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  38.26 
 
 		 460 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  35.86 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.33 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  37.1 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  37.53 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  37.29 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  37.29 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  37.29 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>