More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3854 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  73.21 
 
 		 443 aa  658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  74.36 
 
 		 443 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  75.17 
 
 		 440 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  66.89 
 
 		 444 aa  607  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  66.44 
 
 		 444 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  65.83 
 
 		 448 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  66.21 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  66.21 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  65.16 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  66.21 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  65.99 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  65.76 
 
 		 444 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  65.16 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  69.37 
 
 		 441 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  65.08 
 
 		 446 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  67.13 
 
 		 446 aa  591  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  65.37 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  65.08 
 
 		 444 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  63.95 
 
 		 445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  66.74 
 
 		 441 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  64.57 
 
 		 447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  65.02 
 
 		 447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  66.21 
 
 		 450 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  66.21 
 
 		 451 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  65.08 
 
 		 441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  64.72 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  66.51 
 
 		 442 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  63.57 
 
 		 444 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  66.29 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  65.83 
 
 		 442 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  60.27 
 
 		 442 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  58 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  59.23 
 
 		 444 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  48.1 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.97 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  46.65 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  43.15 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  40.44 
 
 		 451 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  39.91 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  41.88 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  38.15 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  34.42 
 
 		 459 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  40.57 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  39.68 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  35.23 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  40.97 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  40.85 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.99 
 
 		 458 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.1 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  41.71 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.45 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3049  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  35.23 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.77 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1249  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.13 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  38.69 
 
 		 459 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0017  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  37.62 
 
 		 451 aa  266  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  35.81 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.42 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.67 
 
 		 456 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  37.3 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.47 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  39.64 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.28 
 
 		 467 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.94 
 
 		 455 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  36.06 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  38.62 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  35.51 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.12 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  37.41 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  40 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  37.26 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  37.26 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  36.93 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  36.93 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  36.93 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  36.93 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  36.93 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  36.93 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  36.77 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  39.23 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  38.89 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1722  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  33.87 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0538986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  38.62 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  37.36 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  32.9 
 
 		 465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  36.79 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  35.71 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  34.02 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.69 
 
 		 450 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  36.6 
 
 		 459 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  35.05 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  35.43 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  35.93 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>