More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3496 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  96.17 
 
 
444 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  86.93 
 
 
448 aa  777    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  75.63 
 
 
450 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  86.93 
 
 
448 aa  777    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  77.47 
 
 
451 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  86.93 
 
 
448 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  86.93 
 
 
448 aa  777    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  76.77 
 
 
441 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  86.7 
 
 
448 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  96.17 
 
 
444 aa  868    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  86.24 
 
 
448 aa  770    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  82.99 
 
 
442 aa  754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  93.47 
 
 
444 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  86.93 
 
 
448 aa  777    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  82.99 
 
 
442 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  74.6 
 
 
441 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  96.4 
 
 
444 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  81.76 
 
 
445 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  76.19 
 
 
451 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  99.1 
 
 
444 aa  892    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  86.7 
 
 
448 aa  774    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  65.15 
 
 
440 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.08 
 
 
447 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  64.5 
 
 
443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  65.43 
 
 
443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  66.05 
 
 
446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  62.95 
 
 
446 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  63.16 
 
 
444 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  62.01 
 
 
447 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  65.3 
 
 
442 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  61.22 
 
 
442 aa  548  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.61 
 
 
447 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  63.57 
 
 
441 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  63.24 
 
 
442 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  62.79 
 
 
442 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  56.25 
 
 
443 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  58.96 
 
 
444 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  58.54 
 
 
444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.81 
 
 
448 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  47.81 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  44.8 
 
 
461 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  44.27 
 
 
469 aa  339  5e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  42.01 
 
 
442 aa  322  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  42.34 
 
 
470 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.8 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  37.83 
 
 
459 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  39.63 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  40.68 
 
 
453 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  42.21 
 
 
444 aa  292  8e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  41.96 
 
 
465 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  38.64 
 
 
466 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.24 
 
 
459 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  37.79 
 
 
451 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  41.26 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  38.32 
 
 
459 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.9 
 
 
456 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  39.18 
 
 
466 aa  273  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.67 
 
 
446 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  33.33 
 
 
446 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  37.85 
 
 
456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  35.1 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  39.58 
 
 
469 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.73 
 
 
465 aa  269  7e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  37.67 
 
 
456 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  37.5 
 
 
449 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  37.67 
 
 
456 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  40.23 
 
 
437 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  36.85 
 
 
446 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  36.15 
 
 
446 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.8 
 
 
456 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  34.87 
 
 
436 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  35.82 
 
 
463 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  36.15 
 
 
446 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  36.15 
 
 
446 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  36.15 
 
 
446 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  36.01 
 
 
461 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  34.64 
 
 
436 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  38.62 
 
 
457 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  37.04 
 
 
449 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  36.28 
 
 
461 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  35.81 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  36.24 
 
 
446 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.5 
 
 
448 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  37.73 
 
 
448 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  35.78 
 
 
464 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  36.28 
 
 
461 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>