More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38281 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  100 
 
 
461 aa  957    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.75 
 
 
448 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  47.81 
 
 
444 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  45.94 
 
 
443 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  46.42 
 
 
440 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  47.07 
 
 
447 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  46.65 
 
 
447 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  43.85 
 
 
443 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  45.27 
 
 
448 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  43.99 
 
 
447 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  46.1 
 
 
451 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  46.01 
 
 
447 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  46.33 
 
 
451 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  46.28 
 
 
446 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  47.66 
 
 
441 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  45.03 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  45.5 
 
 
444 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  46.37 
 
 
446 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  45.27 
 
 
444 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  45.03 
 
 
448 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  45.27 
 
 
444 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  45.73 
 
 
444 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  45.79 
 
 
442 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  45.03 
 
 
444 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  44.8 
 
 
444 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  44.57 
 
 
445 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  45.33 
 
 
443 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  46.81 
 
 
442 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  46.94 
 
 
450 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  49.27 
 
 
441 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  45.08 
 
 
444 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  45.73 
 
 
441 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  43.26 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  45.15 
 
 
442 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  45.15 
 
 
442 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  42.93 
 
 
442 aa  346  6e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  43.75 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  40.52 
 
 
469 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  37.9 
 
 
442 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  37.93 
 
 
470 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.31 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  34.3 
 
 
455 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  33.96 
 
 
451 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  35.65 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  34.32 
 
 
436 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  36.41 
 
 
465 aa  259  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  35.24 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  35.54 
 
 
463 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
453 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  35.17 
 
 
463 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  34.08 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  34.19 
 
 
459 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  35.38 
 
 
451 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  34.02 
 
 
457 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
456 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  34.32 
 
 
444 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  35.98 
 
 
457 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  34.46 
 
 
467 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  33.64 
 
 
465 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  34.24 
 
 
457 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  33.64 
 
 
459 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  34.58 
 
 
457 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.12 
 
 
461 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.12 
 
 
461 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  34.81 
 
 
456 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  34.33 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  35.66 
 
 
462 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  33.1 
 
 
449 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  33.18 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  35.29 
 
 
467 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  33.92 
 
 
454 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.63 
 
 
451 aa  232  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  34.56 
 
 
458 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.57 
 
 
463 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  33.33 
 
 
460 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  34.58 
 
 
461 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  33.11 
 
 
458 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  32.86 
 
 
449 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  32.86 
 
 
449 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  32.86 
 
 
449 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  32.86 
 
 
449 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  32.86 
 
 
449 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  33.7 
 
 
450 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.36 
 
 
459 aa  231  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  32.62 
 
 
449 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>