More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35479 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  100 
 
 		 465 aa  959    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  35.57 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  35.18 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.4 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  36 
 
 		 442 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  35.06 
 
 		 445 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  35.86 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  36.69 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  36.69 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  36.69 
 
 		 444 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  35.73 
 
 		 444 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  34 
 
 		 447 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  35.62 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  35.76 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  36.47 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  35.35 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  35.39 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  35.06 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  36.2 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  36.28 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  35.12 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  36.41 
 
 		 461 aa  259  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  34.08 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  34.7 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  32.9 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  34.62 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  33.18 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  35.54 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  34.38 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  34.68 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  34.38 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  34.17 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  31.93 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  36.71 
 
 		 469 aa  239  8e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  33.48 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  34.07 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  33.85 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.99 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  32.66 
 
 		 470 aa  216  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  31.53 
 
 		 468 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  28.83 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  29.38 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  29.41 
 
 		 455 aa  196  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  31.42 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  29.62 
 
 		 479 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  33.64 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  30.31 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  27.89 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  30.18 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  29.35 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  30.51 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  30.36 
 
 		 461 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  30.34 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  30.37 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  32.46 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  27.85 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  29.11 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  29.48 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  28.99 
 
 		 463 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  30.02 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  29.86 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  30.2 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  32.73 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  29.8 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  28.57 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  26.61 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  28.67 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  31.44 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  29.93 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  30.49 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  29.28 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  29.71 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  30.94 
 
 		 459 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  31.54 
 
 		 448 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  28.91 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  28.03 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  28.51 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  29.31 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  29.98 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  28.6 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  30.11 
 
 		 464 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  30.11 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  29.66 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  28.91 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  30.34 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  30.34 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  27.33 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  30.94 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  30.6 
 
 		 459 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  29.49 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  29.36 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  29.84 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  28.57 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>