More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0344 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  76.55 
 
 		 450 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  74.72 
 
 		 444 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  87.98 
 
 		 441 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  74.83 
 
 		 445 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  74.83 
 
 		 442 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  75.85 
 
 		 444 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  76.73 
 
 		 451 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  71.95 
 
 		 448 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  74.02 
 
 		 448 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  74.38 
 
 		 442 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  75.85 
 
 		 444 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  76.08 
 
 		 444 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  74.6 
 
 		 444 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  74.94 
 
 		 444 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  76.27 
 
 		 451 aa  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  76.08 
 
 		 444 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.38 
 
 		 447 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  63.78 
 
 		 440 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  64.9 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  64.2 
 
 		 443 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  65.58 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  64.61 
 
 		 444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  62.95 
 
 		 446 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  63.24 
 
 		 447 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  61.96 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.53 
 
 		 447 aa  551  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  63.57 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  63.1 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  60.14 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  61.96 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  61.5 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  55.02 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  57.76 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  49.43 
 
 		 448 aa  428  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  50.71 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  45.73 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  44.44 
 
 		 469 aa  333  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  44.16 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  43.3 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.42 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  38.12 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  39.35 
 
 		 451 aa  292  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  36.49 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  40.33 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.38 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.38 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.14 
 
 		 448 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  39.16 
 
 		 444 aa  276  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  36.74 
 
 		 436 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  36.61 
 
 		 463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.76 
 
 		 465 aa  273  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  36.51 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  41.82 
 
 		 437 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  40.28 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  36.74 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  36.28 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  36.13 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.55 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.44 
 
 		 459 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  35.67 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.67 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  39.36 
 
 		 462 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  31.78 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  36.21 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  37.47 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  37.24 
 
 		 454 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  37.47 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.9 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  38.5 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  37.23 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  35.52 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.24 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.67 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.45 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  37.06 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38.13 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.44 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  38.13 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.85 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  37.71 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  36.77 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>