More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2797 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  902    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  80.27 
 
 
444 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  71.01 
 
 
446 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  80.27 
 
 
447 aa  708    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  73.73 
 
 
446 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  64.57 
 
 
447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  63.96 
 
 
445 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  63.64 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  63.16 
 
 
443 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  62.3 
 
 
440 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  64.79 
 
 
441 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  63.74 
 
 
444 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  63.43 
 
 
444 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  63.29 
 
 
444 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  62.78 
 
 
442 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  62.78 
 
 
442 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  62.56 
 
 
451 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  64.01 
 
 
450 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  63.39 
 
 
443 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  62.84 
 
 
444 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  62.84 
 
 
444 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  62.84 
 
 
444 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  62.61 
 
 
444 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  62.5 
 
 
448 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  63.1 
 
 
451 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  62.53 
 
 
441 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  64.14 
 
 
441 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  61.31 
 
 
442 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  61.31 
 
 
442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  61.54 
 
 
442 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  58.82 
 
 
444 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  55.7 
 
 
442 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  55.76 
 
 
444 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  53.18 
 
 
443 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  49.44 
 
 
447 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.89 
 
 
448 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  46.01 
 
 
461 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  45.7 
 
 
442 aa  349  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.9 
 
 
451 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  41.36 
 
 
455 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  39.01 
 
 
469 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  39.95 
 
 
470 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.55 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.6 
 
 
461 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  34.55 
 
 
459 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.98 
 
 
461 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.98 
 
 
461 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  37.81 
 
 
462 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  38.21 
 
 
461 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  39.22 
 
 
438 aa  274  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  38.84 
 
 
456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.11 
 
 
456 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  36.9 
 
 
454 aa  270  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  35.98 
 
 
451 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  34 
 
 
465 aa  269  8e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  36.47 
 
 
462 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  38.06 
 
 
453 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  39.28 
 
 
444 aa  265  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  41.72 
 
 
437 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  35.84 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  37.59 
 
 
464 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  37.02 
 
 
454 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  36.3 
 
 
448 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  35.02 
 
 
460 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  35.6 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  31.75 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.26 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.92 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.92 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  35.96 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.92 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  36.79 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0070  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.18 
 
 
462 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275257  normal  0.0217188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  35.06 
 
 
454 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  36.81 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  36.34 
 
 
449 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  36.34 
 
 
449 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  36.34 
 
 
449 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  36.34 
 
 
449 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.93 
 
 
446 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  36.34 
 
 
449 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  36.34 
 
 
458 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  36.34 
 
 
449 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  37.78 
 
 
458 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  35.36 
 
 
450 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  36.11 
 
 
465 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.78 
 
 
446 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  35.78 
 
 
448 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  35.92 
 
 
446 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  37.7 
 
 
478 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.15 
 
 
451 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  36.16 
 
 
457 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  36.11 
 
 
465 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  35.02 
 
 
451 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>