More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1041 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  71.01 
 
 		 447 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  73.18 
 
 		 447 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  74.32 
 
 		 444 aa  686    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  914    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  89.02 
 
 		 446 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.08 
 
 		 447 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  65.7 
 
 		 442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  66.51 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  64.61 
 
 		 440 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  65.02 
 
 		 442 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  66.36 
 
 		 450 aa  594  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  64.77 
 
 		 445 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  63.86 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  64.09 
 
 		 444 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  64.64 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  63.41 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  63.41 
 
 		 444 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  63.41 
 
 		 444 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  63.18 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  65.23 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  62.95 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  63.68 
 
 		 448 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  63.22 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  63.22 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  63.22 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  63.86 
 
 		 441 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  63.22 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  63.22 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  63.49 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  62.99 
 
 		 448 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  62.95 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  62.99 
 
 		 448 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  64.19 
 
 		 441 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  61.96 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  60.45 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  59.95 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  61.73 
 
 		 442 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  61.96 
 
 		 442 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  57.89 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  56.15 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  50.34 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  46.94 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  46.28 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  42.57 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  40.98 
 
 		 469 aa  329  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  40.09 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  41.73 
 
 		 470 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  38.92 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  39.86 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.09 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.27 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.01 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.6 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  39.73 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1722  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.7 
 
 		 451 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0538986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  37.41 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  37.41 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  36.72 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  36.72 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.81 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  36.72 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.81 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.81 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.86 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  34.08 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  40.88 
 
 		 462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.34 
 
 		 458 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  36.26 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  37.06 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.18 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3049  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.88 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.84 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  39.43 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  37.47 
 
 		 462 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.05 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  36.81 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.19 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.48 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  40.42 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1002  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.64 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  36.63 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  36.63 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  36.4 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  36.12 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  32.65 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0493  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.18 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.45552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  37.77 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2166  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.81 
 
 		 455 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  35.35 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  37.04 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  36.77 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  37.74 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  35.92 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.44 
 
 		 463 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>