More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4737 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  896    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  86.84 
 
 
443 aa  779    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  77.22 
 
 
440 aa  711    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  73.47 
 
 
447 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  65.61 
 
 
444 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  65.61 
 
 
444 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  65.84 
 
 
444 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  65.84 
 
 
444 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  66.74 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  66.97 
 
 
448 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  68.21 
 
 
441 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  66.29 
 
 
446 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  64.71 
 
 
444 aa  587  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  64.71 
 
 
444 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  67.75 
 
 
446 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  65.45 
 
 
445 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  64.25 
 
 
444 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  65 
 
 
442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  63.66 
 
 
444 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  64.55 
 
 
442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.92 
 
 
447 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  63.16 
 
 
447 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  64.46 
 
 
441 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  65.31 
 
 
451 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  65.75 
 
 
451 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  65.12 
 
 
444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  67.58 
 
 
442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  65.29 
 
 
450 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  64.01 
 
 
441 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  65.9 
 
 
442 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  65.68 
 
 
442 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  61.22 
 
 
442 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  61.02 
 
 
444 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  55.45 
 
 
443 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.76 
 
 
448 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  47.85 
 
 
447 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  45.73 
 
 
461 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  44.62 
 
 
442 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  39.58 
 
 
469 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  42.35 
 
 
470 aa  310  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.38 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  39.36 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  41.39 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  40.67 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  40.09 
 
 
453 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.72 
 
 
446 aa  286  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  39.72 
 
 
458 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  40.91 
 
 
459 aa  280  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.45 
 
 
456 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  42.02 
 
 
444 aa  277  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.3 
 
 
449 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.92 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.15 
 
 
459 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1002  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.22 
 
 
491 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  39.48 
 
 
461 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.74 
 
 
468 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  36.77 
 
 
455 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  39.07 
 
 
456 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  39.48 
 
 
461 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  40.96 
 
 
457 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  41.5 
 
 
438 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.76 
 
 
456 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.39 
 
 
448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.39 
 
 
448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.39 
 
 
448 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  39.01 
 
 
461 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  37.53 
 
 
468 aa  269  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  37.76 
 
 
451 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  42.69 
 
 
437 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.05 
 
 
467 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  39.03 
 
 
462 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.33 
 
 
465 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  41.48 
 
 
468 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3049  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.66 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37 
 
 
463 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0017  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  38.1 
 
 
451 aa  266  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1249  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.75 
 
 
453 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  36.18 
 
 
456 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  36.67 
 
 
449 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  40.16 
 
 
462 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  36.83 
 
 
465 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.17 
 
 
460 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  35.25 
 
 
451 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  37.03 
 
 
446 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  33.87 
 
 
446 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.41 
 
 
454 aa  261  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  36.49 
 
 
436 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  36.93 
 
 
451 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>